RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 CLDN22Q8N7P3 220 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRF-216ENST00000617451 ST7LQ8TDW4 575 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRF-216ENST00000617451 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
PTPRF-216ENST00000617451 C22orf15Q8WYQ4 148 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRF-216ENST00000617451 MAGEB18Q96M61 343 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRF-216ENST00000617451 RBP7Q96R05 134 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRF-216ENST00000617451 ECSITQ9BQ95 431 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRF-216ENST00000617451 MSL2Q9HCI7 577 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRF-216ENST00000617451 NPHS2Q9NP85 383 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRF-216ENST00000617451 IGHMP01871 453 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 RPL27P61353 136 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 PCBD1P61457 104 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 ZMAT1Q5H9K5 638 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 METTL21CQ5VZV1 264 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 OR8J3Q8NGG0 315 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 FNDC8Q8TC99 324 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 LRRC58Q96CX6 371 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 C4orf45Q96LM5 186 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 ELOVL3Q9HB03 270 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 NTN4Q9HB63 628 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 NPTNQ9Y639 398 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 TANC2Q9HCD6 1990 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 HTR3EA5X5Y0 456 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 FXYD1O00168 92 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 PIP5K1CO60331 668 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 FOXH1O75593 365 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 TUSC1Q2TAM9 212 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF774Q6NX45 483 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 BPIFA2Q96DR5 249 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 DCAF16Q9NXF7 216 aa21.06■□□□□ 0.96
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PTPRF-216ENST00000617451 IGHV2-70P01814 119 aa21.05■□□□□ 0.96
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PTPRF-216ENST00000617451 ARHGDIAP52565 204 aa21.05■□□□□ 0.96
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PTPRF-216ENST00000617451 PSG7Q13046 419 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 CDK5R2Q13319 367 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 MTX3Q5HYI7 312 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 ERICH5Q6P6B1 374 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 LRRC75AQ8NAA5 344 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 DEFB108BQ8NET1 73 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF583Q96ND8 569 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 SIKE1Q9BRV8 207 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 A0A0G2JND7 137 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 EDF1O60869 148 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 SBK2P0C263 348 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 IFI30P13284 250 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 CTXN1P60606 82 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 ST3GAL3Q11203 375 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 CYBRD1Q53TN4 286 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 FAM205BPQ63HN1 556 aa21.04■□□□□ 0.96
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PTPRF-216ENST00000617451 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
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PTPRF-216ENST00000617451 TMEM106BQ9NUM4 274 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 A4GNTQ9UNA3 340 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 PPIAL4AQ9Y536 164 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 C12orf71A8MTZ7 269 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
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PTPRF-216ENST00000617451 IGFN1Q86VF2 1251 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 C10orf82Q8WW14 230 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1W2PPL8 197 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 A6NIZ1 184 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 NPPAP01160 153 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 SCG5P05408 212 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 HKR1P10072 659 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 KDELR2P33947 212 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 RAP1BP61224 184 aa21.02■□□□□ 0.96
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PTPRF-216ENST00000617451 FHL1Q13642 323 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 COQ5Q5HYK3 327 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 SPICQ8N5J4 248 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF283Q8N7M2 679 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 SAMD8Q96LT4 415 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 PRRC1Q96M27 445 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF747Q9BV97 191 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 POLE4Q9NR33 117 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 TBCCD1Q9NVR7 557 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 EGFL7Q9UHF1 273 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRF-216ENST00000617451 TRAPPC2LH3BP13 241 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRF-216ENST00000617451 ABHD16AO95870 558 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRF-216ENST00000617451 COX5BP10606 129 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRF-216ENST00000617451 GSTM3P21266 225 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRF-216ENST00000617451 FUT4P22083 530 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRF-216ENST00000617451 TUBG1P23258 451 aa21.01■□□□□ 0.95
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