RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602516.1

HCG18-244, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

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Gene HCG18, Length 2,890 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-244ENST00000602516 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 SLC2A9Q9NRM0 540 aa6.9□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa6.9□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 C5orf58C9J3I9 102 aa6.9□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 PCDH7O60245 1069 aa6.9□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 IFNA5P01569 189 aa6.9□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 ERGP11308 486 aa6.9□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 MSR1P21757 451 aa6.9□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 FCARP24071 287 aa6.9□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 RAB9AP51151 201 aa6.9□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 MVDP53602 400 aa6.9□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 GABARAPL2P60520 117 aa6.9□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 BTG2P78543 158 aa6.9□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 RGNQ15493 299 aa6.9□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 C6orf141Q5SZD1 244 aa6.9□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 KIAA1211LQ6NV74 962 aa6.9□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa6.9□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 ASCL4Q6XD76 172 aa6.9□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 LINC01551Q86U37 167 aa6.9□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa6.9□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 FGF13Q92913 245 aa6.9□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 TMEM19Q96HH6 336 aa6.9□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 EMC7Q9NPA0 242 aa6.9□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 PHF11Q9UIL8 331 aa6.9□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa6.9□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 CHD9Q3L8U1 2897 aa6.9□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 OR5H14A6NHG9 310 aa6.9□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 ANXA2P2A6NMY6 339 aa6.9□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 C9J4A7 227 aa6.9□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 E9PQ18 207 aa6.9□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 FAM227AF5H4B4 570 aa6.9□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 CDIPTO14735 213 aa6.9□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 YIF1AO95070 293 aa6.9□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 ZNF682O95780 498 aa6.9□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 ITGA5P08648 1049 aa6.9□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 EPHA1P21709 976 aa6.9□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 OPRD1P41143 372 aa6.9□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 HOXC5Q00444 222 aa6.9□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 NAAAQ02083 359 aa6.9□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 PDGFRLQ15198 375 aa6.9□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 ZNF385BQ569K4 471 aa6.9□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.9□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 DCAF12L2Q5VW00 463 aa6.9□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 LCTLQ6UWM7 567 aa6.9□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 TCF24Q7RTU0 167 aa6.9□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 COMMD6Q7Z4G1 85 aa6.9□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 CALHM1Q8IU99 346 aa6.9□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 RNF152Q8N8N0 203 aa6.9□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 ASB17Q8WXJ9 295 aa6.9□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 C16orf58Q96GQ5 468 aa6.9□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 TRIB1Q96RU8 372 aa6.9□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 AIF1LQ9BQI0 150 aa6.9□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 FAAP24Q9BTP7 215 aa6.9□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 WDR54Q9H977 334 aa6.9□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 PRSS16Q9NQE7 514 aa6.9□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 GPATCH2Q9NW75 528 aa6.9□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 ANGPT4Q9Y264 503 aa6.9□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 CDH23Q9H251 3354 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 PPIAL4EA0A075B759 164 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 PPIAL4DF5H284 164 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 F6UZH7 168 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 PHOX2AO14813 284 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 SEMA7AO75326 666 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 NME6O75414 186 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 TSPAN13O95857 204 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 FABP3P05413 133 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 FURINP09958 794 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 PPIAL4FP0DN26 164 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 RPA2P15927 270 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 CERS1P27544 350 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 GGT2P36268 569 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 MTNR1AP48039 350 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 TNFSF10P50591 281 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 SHHQ15465 462 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 SAMD13Q5VXD3 122 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 LIPKQ5VXJ0 399 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 FAM71E1Q6IPT2 247 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 TCTN3Q6NUS6 607 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 DRAM2Q6UX65 266 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 OR4S2Q8NH73 311 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 HIST1H2BAQ96A08 127 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 HSH2DQ96JZ2 352 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 SFXN1Q9H9B4 322 aa6.89□□□□□ -1.31
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