RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598362.1

GRAMD1A-208, Transcript of GRAM domain containing 1A, human

TSL 2

Gene GRAMD1A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRAMD1A-208	ENST00000598362	CENPA	P49450	140 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	SLC25A1	P53007	311 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	CDH11	P55287	796 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	CDK5	Q00535	292 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	TRIP10	Q15642	601 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	SGCA	Q16586	387 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	SLC36A2	Q495M3	483 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	OTP	Q5XKR4	325 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	OR6V1	Q8N148	313 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	LRRC18	Q8N456	261 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	OR9Q1	Q8NGQ5	310 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	OR2T4	Q8NH00	348 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	EME1	Q96AY2	570 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	DDO	Q99489	341 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	TEX12	Q9BXU0	123 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	B9D1	Q9UPM9	204 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	FKBP7	Q9Y680	259 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	FAM183A	A6NL82	134 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362		M0R129	80 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	MGRN1	O60291	552 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	MPZL1	O95297	269 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	PLAU	P00749	431 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	HMGN1	P05114	100 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	GYPB	P06028	91 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	CLU	P10909	449 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ZNF32	P17041	273 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	SPI1	P17947	270 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	EPHA2	P29317	976 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	CALCR	P30988	508 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	RAB1A	P62820	205 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	NAAA	Q02083	359 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	HSF2	Q03933	536 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	GLO1	Q04760	184 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	PIGF	Q07326	219 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	AQP6	Q13520	282 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	RAB39A	Q14964	217 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	FAM27B	Q5VT28	67 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	C12orf73	Q69YU5	71 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	FBXO17	Q96EF6	278 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ZNF75A	Q96N20	296 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	RNF121	Q9H920	327 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		6.52	□□□□□ -1.37
GRAMD1A-208	ENST00000598362	TVP23A	A6NH52	213 aa		6.52	□□□□□ -1.37
GRAMD1A-208	ENST00000598362	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		6.52	□□□□□ -1.37
GRAMD1A-208	ENST00000598362	SHISA9	B4DS77	424 aa		6.52	□□□□□ -1.37
GRAMD1A-208	ENST00000598362	INAFM1	C9JVW0	142 aa		6.52	□□□□□ -1.37
GRAMD1A-208	ENST00000598362	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37

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