RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 MLIPQ5VWP3 458 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 LIPKQ5VXJ0 399 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 MORN5Q5VZ52 161 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 LAIR2Q6ISS4 152 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 C17orf107Q6ZR85 190 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 AHSA2Q719I0 299 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 PAQR7Q86WK9 346 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 ENTHD1Q8IYW4 607 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF679Q8IYX0 411 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF441Q8N8Z8 693 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 AQP11Q8NBQ7 271 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 STEAP2Q8NFT2 490 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 OR4E2Q8NGC2 313 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 OR9Q2Q8NGE9 314 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 OR52J3Q8NH60 311 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 ASB5Q8WWX0 329 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 PHYHIPQ92561 330 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 RAB8BQ92930 207 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 MYDGFQ969H8 173 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 BORCS5Q969J3 196 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 MCHR2Q969V1 340 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 NXPE2Q96DL1 559 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF354BQ96LW1 612 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 PRRC1Q96M27 445 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 AMDHD1Q96NU7 426 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 COL21A1Q96P44 957 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 COPS4Q9BT78 406 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 FUNDC2Q9BWH2 189 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 GSDMCQ9BYG8 508 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 AICDAQ9GZX7 198 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 SRMSQ9H3Y6 488 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 DUSP21Q9H596 190 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 PLGRKTQ9HBL7 147 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 MS4A12Q9NXJ0 267 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 CALML5Q9NZT1 146 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 ERVK-18Q9QC07 812 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 WNT16Q9UBV4 365 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 TEKT2Q9UIF3 430 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 MMP17Q9ULZ9 603 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 RNF6Q9Y252 685 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 ASB4Q9Y574 426 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 MAB21L2Q9Y586 359 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 SPACA6W5XKT8 324 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 CEP192Q8TEP8 1941 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 CHD8Q9HCK8 2581 aa3.65□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 SCN3AQ9NY46 2000 aa3.65□□□□□ -1.82
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A0J9YVX5 310 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A0J9YY10 115 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CLEC18AA5D8T8 446 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 EFCAB10A6NFE3 127 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CLDN24A6NM45 220 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 OR5K4A6NMS3 321 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 C2orf74A8MZ97 194 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 B8ZZF3 427 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 LGALS8O00214 317 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 OR10H3O60404 316 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 B4GALT2O60909 372 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 TSC22D2O75157 780 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 WBP4O75554 376 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 STATHP02808 62 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ATP1B1P05026 303 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CDK1P06493 297 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CT45A8P0DMV1 189 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CT45A9P0DMV2 189 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CDK4P11802 303 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 UGT2B7P16662 529 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 GABRG2P18507 467 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 MAGP20916 626 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 NUDT1P36639 197 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 FEN1P39748 380 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 MAP2K4P45985 399 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 GSSP48637 474 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 TPMTP51580 245 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CRISP1P54107 249 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 LIM2P55344 173 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 RAB8AP61006 207 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 BTN3A2P78410 334 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 GPR50Q13585 617 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 EXT1Q16394 746 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SYPL1Q16563 259 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 MOGQ16653 247 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 DUSP7Q16829 419 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 DGUOKQ16854 277 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF528Q3MIS6 628 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CT45A2Q5DJT8 189 aa3.65□□□□□ -1.83
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