RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 KRT77Q7Z794 578 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 OR2G2Q8NGZ5 317 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 DCBLD2Q96PD2 775 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 BARHL1Q9BZE3 327 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 FRRS1LQ9P0K9 344 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 OR4C45A6NMZ5 311 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 RPP14O95059 124 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 DCTDP32321 178 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 RIDAP52758 137 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 INSL4Q14641 139 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 CEACAM19Q7Z692 300 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 ABHD3Q8WU67 409 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 C4orf45Q96LM5 186 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 ULBP2Q9BZM5 246 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 C1orf198Q9H425 327 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 EXO5Q9H790 373 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 SEC61A2Q9H9S3 476 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 BCO1Q9HAY6 547 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 SNTG1Q9NSN8 517 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 EMC3Q9P0I2 261 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 LHFPL6Q9Y693 200 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 FREM2Q5SZK8 3169 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 AQP7O14520 342 aa20.13■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 ZFPL1O95159 310 aa20.13■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 CDAP32320 146 aa20.13■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 OPRL1P41146 370 aa20.13■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
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CAPNS1-207ENST00000589146 LINC00346Q8IVM7 164 aa20.13■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 SIAH3Q8IW03 269 aa20.13■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 CPT1CQ8TCG5 803 aa20.13■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 HSD17B8Q92506 261 aa20.13■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 NABP1Q96AH0 204 aa20.13■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 LINC00470Q9BZP3 86 aa20.13■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 PRDM14Q9GZV8 571 aa20.13■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 EMC7Q9NPA0 242 aa20.13■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa20.13■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 PLSCR2Q9NRY7 297 aa20.13■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF175Q9Y473 711 aa20.13■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 LRP12Q9Y561 859 aa20.13■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM212A6NML5 194 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 VGLL3A8MV65 326 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 DVL2O14641 736 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 WNT11O96014 354 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 UCHL1P09936 223 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 CLEC2LP0C7M8 214 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 MSR1P21757 451 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF84P51523 738 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 ZMAT1Q5H9K5 638 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF544Q6NX49 715 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 TPRA1Q86W33 373 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 PRSS35Q8N3Z0 413 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 OR5AK2Q8NH90 309 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 S100ZQ8WXG8 99 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 NELFAQ9H3P2 528 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 GP6Q9HCN6 339 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 AKIP1Q9NQ31 210 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 PARPBPQ9NWS1 579 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 R4GMQ9 66 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 SHISA3A0PJX4 238 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 K7ENP7 123 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 KIR3DL2P43630 455 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 BMXP51813 675 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 HIST1H3AP68431 136 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 HIST2H3AQ71DI3 136 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 CHMP1BQ7LBR1 199 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 CATSPERDQ86XM0 798 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 OR10S1Q8NGN2 331 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 SLAMF6Q96DU3 332 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 PEX16Q9Y5Y5 336 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 OR6C65A6NJZ3 312 aa20.1■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 CASKO14936 926 aa20.1■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 NPR2P20594 1047 aa20.1■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 INAQ16352 499 aa20.1■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 WDR38Q5JTN6 314 aa20.1■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 CORO6Q6QEF8 472 aa20.1■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 GPR137CQ8N3F9 429 aa20.1■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 IL17RDQ8NFM7 739 aa20.1■□□□□ 0.81
CAPNS1-207ENST00000589146 OR13C5Q8NGS8 318 aa20.1■□□□□ 0.81
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