RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 C1orf198Q9H425 327 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 ANKRD19PQ9H560 264 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 RERGLQ9H628 205 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 GORASP2Q9H8Y8 452 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 SIAEQ9HAT2 523 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 SMURF2Q9HAU4 748 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 NDUFAF4Q9P032 175 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 POMPQ9Y244 141 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 CUBNO60494 3623 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 SONP18583 2426 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1W2PRQ8 180 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM129A0AVI4 362 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 H7C1C5 153 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 M0R233 179 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 CDC42EP2O14613 210 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 SYNGR3O43761 229 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 CD5LO43866 347 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 NDUFB2O95178 105 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 GADD45GO95257 159 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 TNFAIP8O95379 198 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 IGHMP01871 453 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 HSD17B1P14061 328 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 DAOP14920 347 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF32P17041 273 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 USF1P22415 310 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 LAP3P28838 519 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 CENPAP49450 140 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 AQP4P55087 323 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 LCN6P62502 163 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 VLDLRP98155 873 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 SPIBQ01892 262 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP1-1Q07627 177 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 DGCR6Q14129 220 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 ALKBH6Q3KRA9 238 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 C10orf128Q5T292 105 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 LPCAT4Q643R3 524 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
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PTPRM-214ENST00000583153 FAM86B1Q8N7N1 296 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 LRRC75AQ8NAA5 344 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF540Q8NDQ6 660 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 SLC7A13Q8TCU3 470 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 C11orf40Q8WZ69 217 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 C7orf34Q96L11 122 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 Q96M85 177 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 TSPAN32Q96QS1 320 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 SEPHS2Q99611 448 aa7.17□□□□□ -1.26
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PTPRM-214ENST00000583153 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 CEPT1Q9Y6K0 416 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 ALPK2Q86TB3 2170 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 ABCA1O95477 2261 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa7.16□□□□□ -1.26
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PTPRM-214ENST00000583153 UNC119BA6NIH7 251 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 C12orf71A8MTZ7 269 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 A8MV72 311 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 NDUFS8O00217 210 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 ARPC2O15144 300 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 OR10H3O60404 316 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 PFDN1O60925 122 aa7.16□□□□□ -1.26
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PTPRM-214ENST00000583153 CD14P08571 375 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 APEHP13798 732 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 STOMP27105 288 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 APEX1P27695 318 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
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PTPRM-214ENST00000583153 ALDH3B1P43353 468 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 NR4A2P43354 598 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 ALDH3B2P48448 385 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 EVX1P49640 407 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 GDI2P50395 445 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 UCP2P55851 309 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 PCBD1P61457 104 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 SEC23BQ15437 767 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 NKPD1Q17RQ9 610 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM249Q2WGJ8 235 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 FAM27BQ5VT28 67 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 CYB5R2Q6BCY4 276 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa7.16□□□□□ -1.26
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