RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIP10	Q15642	601 aa		18.61	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		18.61	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	SPATS1	Q496A3	300 aa		18.61	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		18.61	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		18.61	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		18.61	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	RDH5	Q92781	318 aa		18.61	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	HPS1	Q92902	700 aa		18.61	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	RASD2	Q96D21	266 aa		18.61	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	WAC	Q9BTA9	647 aa		18.61	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	CHODL	Q9H9P2	273 aa		18.61	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		18.61	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		18.61	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		18.6	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		18.6	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	C17orf100	A8MU93	164 aa		18.6	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	IGFBP5	P24593	272 aa		18.6	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	MAGEB1	P43366	347 aa		18.6	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	18.6	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	18.6	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	KRT72	Q14CN4	511 aa		18.6	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		18.6	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		18.6	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		18.6	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM166A	Q6J272	317 aa		18.6	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF774	Q6NX45	483 aa		18.6	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		18.6	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		18.6	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	YIPF5	Q969M3	257 aa		18.6	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	18.6	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		18.6	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		18.6	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	EMC7	Q9NPA0	242 aa		18.6	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	18.6	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	18.6	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR160	Q9UJ42	338 aa		18.6	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		18.59	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	IMPA2	O14732	288 aa		18.59	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	RP2	O75695	350 aa		18.59	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	TXNDC12	O95881	172 aa		18.59	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM157C	P0CG43	387 aa		18.59	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	ACHE	P22303	614 aa		18.59	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	C16orf89	Q6UX73	402 aa		18.59	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		18.59	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	FITM2	Q8N6M3	262 aa		18.59	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	C1orf159	Q96HA4	380 aa		18.59	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	SNX18	Q96RF0	628 aa		18.59	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		18.59	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	SYT4	Q9H2B2	425 aa		18.59	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		18.59	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	18.59	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	NDE1	Q9NXR1	346 aa		18.59	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	AURKC	Q9UQB9	309 aa		18.59	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	UNC119B	A6NIH7	251 aa		18.58	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	GADD45G	O95257	159 aa		18.58	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	SMIM11A	P58511	58 aa		18.58	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		18.58	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		18.58	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		18.58	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		18.58	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		18.58	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	18.58	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		18.58	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		18.58	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		18.58	■□□□□ 0.57
PPP4C-205	ENST00000563200	NGF	P01138	241 aa		18.57	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	MPV17	P39210	176 aa		18.57	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	MMP15	P51511	669 aa		18.57	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM33	P57088	247 aa		18.57	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	SPIB	Q01892	262 aa		18.57	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		18.57	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	18.57	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		18.57	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	ADCK1	Q86TW2	530 aa		18.57	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		18.57	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		18.57	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	18.57	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	18.57	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	BEX2	Q9BXY8	128 aa		18.57	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	18.57	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	SOCS2	O14508	198 aa		18.57	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC16A7	O60669	478 aa		18.57	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	TGFA	P01135	160 aa		18.57	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	FABP3	P05413	133 aa		18.57	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	COX5B	P10606	129 aa		18.57	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	FPR3	P25089	353 aa		18.57	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	18.57	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	MOG	Q16653	247 aa		18.57	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		18.57	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		18.57	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		18.57	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		18.57	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	SNX33	Q8WV41	574 aa		18.57	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	18.57	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		18.57	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		18.57	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	NUAK2	Q9H093	628 aa		18.57	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	18.57	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	18.56	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	18.56	■□□□□ 0.56

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