RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552294.1

CTDSP2-208, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP2, Length 436 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 UGT2B15P54855 530 aa5.6□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 FHL1Q13642 323 aa5.6□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 SELPLGQ14242 412 aa5.6□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 GNA13Q14344 377 aa5.6□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 SGCAQ16586 387 aa5.6□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 DUSP7Q16829 419 aa5.6□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 PAGE3Q5JUK9 113 aa5.6□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 ARMC4Q5T2S8 1044 aa5.6□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 OGFOD2Q6N063 350 aa5.6□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 SLC27A4Q6P1M0 643 aa5.6□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 TMEM53Q6P2H8 277 aa5.6□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 ULK3Q6PHR2 472 aa5.6□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa5.6□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa5.6□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF620Q6ZNG0 422 aa5.6□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 FUNDC1Q8IVP5 155 aa5.6□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 OR6T1Q8NGN1 323 aa5.6□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 MRAPQ8TCY5 172 aa5.6□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 ASB10Q8WXI3 467 aa5.6□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF566Q969W8 418 aa5.6□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 CMBLQ96DG6 245 aa5.6□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF607Q96SK3 696 aa5.6□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 ASPNQ9BXN1 380 aa5.6□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 BCL2L14Q9BZR8 327 aa5.6□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 OR2H1Q9GZK4 316 aa5.6□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 WDR76Q9H967 626 aa5.6□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 C12orf10Q9HB07 376 aa5.6□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 EMC7Q9NPA0 242 aa5.6□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa5.6□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa5.6□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 DNAJB11Q9UBS4 358 aa5.6□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 HAO1Q9UJM8 370 aa5.6□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 SLC22A23A1A5C7 686 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 H7C1C5 153 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 TIMM23O14925 209 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 RNF13O43567 381 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 PIP5K1CO60331 668 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 HLA-DPB1P04440 258 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 ASAH2BP0C7U1 165 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 ZCCHC18P0CG32 403 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 BMP2P12643 396 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 RPS2P15880 293 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 PRKAR1BP31321 381 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 APLNRP35414 380 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 MDH2P40926 338 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 SLC1A6P48664 564 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 RPL14P50914 215 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 KRTAP10-11P60412 298 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 LCN6P62502 163 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 HSF2Q03933 536 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 BST1Q10588 318 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 COX10Q12887 443 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 MPPED2Q15777 294 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF718Q3SXZ3 478 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 SLC36A2Q495M3 483 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 MMEL1Q495T6 779 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 ESCO2Q56NI9 601 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 MTX3Q5HYI7 312 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 CEP85LQ5SZL2 805 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 C10orf128Q5T292 105 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 SLC35E4Q6ICL7 350 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 OR2T2Q6IF00 324 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 IGFN1Q86VF2 1251 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 MOGAT3Q86VF5 341 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 PTOV1Q86YD1 416 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 NUDCD3Q8IVD9 361 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 NKAIN4Q8IVV8 208 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 IFT20Q8IY31 132 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 KLHL36Q8N4N3 616 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 VPS37AQ8NEZ2 397 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 NOXO1Q8NFA2 376 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 OR6S1Q8NH40 331 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 LHX4Q969G2 390 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 SLC47A1Q96FL8 570 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 AJUBAQ96IF1 538 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 MEGF10Q96KG7 1140 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 C4orf45Q96LM5 186 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 SAMD8Q96LT4 415 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 TMEM43Q9BTV4 400 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 SIRPDQ9H106 197 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 ADA2Q9NZK5 511 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 SELENONQ9NZV5 590 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 VAPAQ9P0L0 249 aa5.59□□□□□ -1.51
CTDSP2-208ENST00000552294 OR5V1Q9UGF6 321 aa5.59□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms