RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
CS-214ENST00000548849 KLHL36Q8N4N3 616 aa14.35□□□□□ -0.11
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CS-214ENST00000548849 DPP10Q8N608 796 aa14.35□□□□□ -0.11
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CS-214ENST00000548849 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
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CS-214ENST00000548849 TXNIPQ9H3M7 391 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-214ENST00000548849 ELOVL3Q9HB03 270 aa14.35□□□□□ -0.11
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CS-214ENST00000548849 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa14.34□□□□□ -0.11
CS-214ENST00000548849 TRAPPC2LH3BP13 241 aa14.34□□□□□ -0.11
CS-214ENST00000548849 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP14.34□□□□□ -0.11
CS-214ENST00000548849 IGHMP01871 453 aa14.34□□□□□ -0.11
CS-214ENST00000548849 TNFRSF1BP20333 461 aa14.34□□□□□ -0.11
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CS-214ENST00000548849 ZNF154Q13106 437 aa14.34□□□□□ -0.11
CS-214ENST00000548849 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP14.34□□□□□ -0.11
CS-214ENST00000548849 VMACQ2NL98 169 aa14.34□□□□□ -0.11
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CS-214ENST00000548849 ARL9Q6T311 187 aa14.34□□□□□ -0.11
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CS-214ENST00000548849 C4orf45Q96LM5 186 aa14.34□□□□□ -0.11
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CS-214ENST00000548849 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
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CS-214ENST00000548849 CDK5R2Q13319 367 aa14.33□□□□□ -0.12
CS-214ENST00000548849 ALG10Q5BKT4 473 aa14.33□□□□□ -0.12
CS-214ENST00000548849 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP14.33□□□□□ -0.12
CS-214ENST00000548849 CCDC80Q76M96 950 aa14.33□□□□□ -0.12
CS-214ENST00000548849 ZER1Q7Z7L7 766 aa14.33□□□□□ -0.12
CS-214ENST00000548849 CLDN22Q8N7P3 220 aa14.33□□□□□ -0.12
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CS-214ENST00000548849 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
CS-214ENST00000548849 INSIG2Q9Y5U4 225 aa14.33□□□□□ -0.12
CS-214ENST00000548849 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa14.33□□□□□ -0.12
CS-214ENST00000548849 A0A1W2PPL8 197 aa14.32□□□□□ -0.12
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CS-214ENST00000548849 NPIPB4C9JG80 1138 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-214ENST00000548849 ICMTO60725 284 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-214ENST00000548849 ABHD16AO95870 558 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-214ENST00000548849 ZNF12P17014 697 aa14.32□□□□□ -0.12
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CS-214ENST00000548849 TUSC1Q2TAM9 212 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-214ENST00000548849 TMEM155Q4W5P6 130 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-214ENST00000548849 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP14.32□□□□□ -0.12
CS-214ENST00000548849 OR2Z1Q8NG97 314 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-214ENST00000548849 FNDC8Q8TC99 324 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-214ENST00000548849 DYDC1Q8WWB3 177 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-214ENST00000548849 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
CS-214ENST00000548849 SAMD8Q96LT4 415 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-214ENST00000548849 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP14.32□□□□□ -0.12
CS-214ENST00000548849 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP14.32□□□□□ -0.12
CS-214ENST00000548849 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
CS-214ENST00000548849 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP14.32□□□□□ -0.12
CS-214ENST00000548849 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
CS-214ENST00000548849 BAG5Q9UL15 447 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-214ENST00000548849 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP14.32□□□□□ -0.12
CS-214ENST00000548849 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-214ENST00000548849 GSTM3P21266 225 aa14.31□□□□□ -0.12
CS-214ENST00000548849 OR1E2P47887 323 aa14.31□□□□□ -0.12
CS-214ENST00000548849 GZMMP51124 257 aa14.31□□□□□ -0.12
CS-214ENST00000548849 CTXN1P60606 82 aa14.31□□□□□ -0.12
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CS-214ENST00000548849 SLC25A28Q96A46 364 aa14.31□□□□□ -0.12
CS-214ENST00000548849 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
CS-214ENST00000548849 HIF3AQ9Y2N7 669 aa14.31□□□□□ -0.12
CS-214ENST00000548849 C12orf71A8MTZ7 269 aa14.3□□□□□ -0.12
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CS-214ENST00000548849 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
CS-214ENST00000548849 IFI30P13284 250 aa14.3□□□□□ -0.12
CS-214ENST00000548849 MSR1P21757 451 aa14.3□□□□□ -0.12
CS-214ENST00000548849 IL13RA1P78552 427 aa14.3□□□□□ -0.12
CS-214ENST00000548849 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
CS-214ENST00000548849 ZMYND11Q15326 602 aa14.3□□□□□ -0.12
CS-214ENST00000548849 ESCO2Q56NI9 601 aa14.3□□□□□ -0.12
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