RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540665.5

TTC28-AS1-221, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 802 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-221ENST00000540665 COX5BP10606 129 aa13.92□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 APEX1P27695 318 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NOS3P29474 1203 aa13.92□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RAD52P43351 418 aa13.92□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SCRN3Q0VDG4 424 aa13.92□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 AQP6Q13520 282 aa13.92□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KCNMB1Q16558 191 aa13.92□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MSMPQ1L6U9 139 aa13.92□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa13.92□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C1orf174Q8IYL3 243 aa13.92□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OR10H5Q8NGA6 315 aa13.92□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RHNO1Q9BSD3 238 aa13.92□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NUAK2Q9H093 628 aa13.92□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RACGAP1Q9H0H5 632 aa13.92□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RAB1BQ9H0U4 201 aa13.92□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 WNT5BQ9H1J7 359 aa13.92□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 EGLN3Q9H6Z9 239 aa13.92□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 U3KQV3 271 aa13.92□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NF1P21359 2839 aa13.92□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 BHLHE40O14503 412 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SYNGR3O43761 229 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SCG5P05408 212 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HEXAP06865 529 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GAAP10253 952 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CCL2P13500 99 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 UCP2P55851 309 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RIPPLY3P57055 190 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LEG1Q6P5S2 330 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CD300LDQ6UXZ3 194 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SPATA24Q86W54 205 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNF525Q8N782 197 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OR10G2Q8NGC3 310 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 AKR7LQ8NHP1 331 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 REG4Q9BYZ8 158 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 YY1AP1Q9H869 796 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DYNLRB1Q9NP97 96 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 EMC7Q9NPA0 242 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ATPIF1Q9UII2 106 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 BAIAP2Q9UQB8 552 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LOC100509620A0A075B734 347 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RNF223E7ERA6 249 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 M0R233 179 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NDUFS8O00217 210 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FAM157BP0CG42 384 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNF250P15622 560 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SLC25A16P16260 332 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GDI2P50395 445 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 COX10Q12887 443 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 UGT2A3Q6UWM9 527 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CLEC9AQ6UXN8 241 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZBTB46Q86UZ6 589 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OR8D4Q8NGM9 314 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OR4K13Q8NH42 304 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C10orf105Q8TEF2 133 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FAM168AQ92567 244 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NMNAT3Q96T66 252 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SMR3AQ99954 134 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MS4A5Q9H3V2 200 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TBC1D23Q9NUY8 699 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa13.89□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C5orf49A4QMS7 147 aa13.89□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-221ENST00000540665 H3BSA7 217 aa13.89□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DCTN6O00399 190 aa13.89□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SELENOVP59797 346 aa13.89□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GLO1Q04760 184 aa13.89□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP13.89□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNF774Q6NX45 483 aa13.89□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OR6V1Q8N148 313 aa13.89□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LNX2Q8N448 690 aa13.89□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SDR9C7Q8NEX9 313 aa13.89□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GIPC3Q8TF64 312 aa13.89□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C11orf40Q8WZ69 217 aa13.89□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TSSK2Q96PF2 358 aa13.89□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SYT3Q9BQG1 590 aa13.89□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RERGLQ9H628 205 aa13.89□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-221ENST00000540665 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-221ENST00000540665 B9D1Q9UPM9 204 aa13.89□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-221ENST00000540665 A0A096LNT2 108 aa13.88□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OR6C68A6NDL8 312 aa13.88□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SGCEO43556 437 aa13.88□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DOK2O60496 412 aa13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.1 ms