RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532538.1

BRPF3-210, Transcript of bromodomain and PHD finger containing 3, humanhuman

TSL 4

Gene BRPF3, Length 567 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3-210ENST00000532538 FAM27BQ5VT28 67 aa12.87□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 NANOGP8Q6NSW7 305 aa12.87□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 ZNF774Q6NX45 483 aa12.87□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 CCDC80Q76M96 950 aa12.87□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 SPICQ8N5J4 248 aa12.87□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa12.87□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 ZDHHC22Q8N966 263 aa12.87□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 OR2Z1Q8NG97 314 aa12.87□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 FNDC8Q8TC99 324 aa12.87□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 TSPEARQ8WU66 669 aa12.87□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 NABP1Q96AH0 204 aa12.87□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 DUX5Q96PT3 197 aa12.87□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 ALG12Q9BV10 488 aa12.87□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 MRI1Q9BV20 369 aa12.87□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 VIPAS39Q9H9C1 493 aa12.87□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 ESM1Q9NQ30 184 aa12.87□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 EGFL7Q9UHF1 273 aa12.87□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa12.87□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 ANK2Q01484 3957 aa12.87□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 C12orf71A8MTZ7 269 aa12.86□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 CST2P09228 141 aa12.86□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 TNFRSF1AP19438 455 aa12.86□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 ST3GAL3Q11203 375 aa12.86□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 RABL3Q5HYI8 236 aa12.86□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 C1orf94Q6P1W5 598 aa12.86□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa12.86□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 CLDN22Q8N7P3 220 aa12.86□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 BPIFA2Q96DR5 249 aa12.86□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 MAGEB18Q96M61 343 aa12.86□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 SEPHS2Q99611 448 aa12.86□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 GPA33Q99795 319 aa12.86□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 WNT5BQ9H1J7 359 aa12.86□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 AUP1Q9Y679 476 aa12.86□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 A6NIZ1 184 aa12.85□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 MSR1P21757 451 aa12.85□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 RPL4P36578 427 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 YAP1P46937 504 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 HTR5AP47898 357 aa12.85□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 RAP1BP61224 184 aa12.85□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 RAP1AP62834 184 aa12.85□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 BAMBIQ13145 260 aa12.85□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 ERICH5Q6P6B1 374 aa12.85□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 OR51A7Q8NH64 312 aa12.85□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 LRRC58Q96CX6 371 aa12.85□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 FNDC11Q9BVV2 318 aa12.85□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 RERGLQ9H628 205 aa12.85□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 TMEM106BQ9NUM4 274 aa12.85□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 OPN4Q9UHM6 478 aa12.85□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 NUP50Q9UKX7 468 aa12.85□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 TRAV27A0A087WT01 109 aa12.84□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 H3BSA7 217 aa12.84□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 H7C1C5 153 aa12.84□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 MRASO14807 208 aa12.84□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 SURF4O15260 269 aa12.84□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 DOK2O60496 412 aa12.84□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 THRBP10828 461 aa12.84□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 GZMMP51124 257 aa12.84□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 LCN6P62502 163 aa12.84□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 CYBRD1Q53TN4 286 aa12.84□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 ESCO2Q56NI9 601 aa12.84□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 SPRNQ5BIV9 151 aa12.84□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 TTMPQ5BVD1 217 aa12.84□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 FAM205BPQ63HN1 556 aa12.84□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 SHISA2Q6UWI4 295 aa12.84□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 OAFQ86UD1 273 aa12.84□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 ATG16L2Q8NAA4 619 aa12.84□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 NPEPL1Q8NDH3 523 aa12.84□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 LZICQ8WZA0 190 aa12.84□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 EMC7Q9NPA0 242 aa12.84□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 MMP26Q9NRE1 261 aa12.84□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 DCAF16Q9NXF7 216 aa12.84□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 RHCGQ9UBD6 479 aa12.84□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 GRHPRQ9UBQ7 328 aa12.84□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 OR5V1Q9UGF6 321 aa12.84□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa12.84□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 HIF3AQ9Y2N7 669 aa12.84□□□□□ -0.35
BRPF3-210ENST00000532538 NPIPB13A6NJU9 1138 aa12.83□□□□□ -0.36
BRPF3-210ENST00000532538 EFCAB9A8MZ26 197 aa12.83□□□□□ -0.36
BRPF3-210ENST00000532538 NPIPB4C9JG80 1138 aa12.83□□□□□ -0.36
BRPF3-210ENST00000532538 FBP2O00757 339 aa12.83□□□□□ -0.36
BRPF3-210ENST00000532538 XKRYO14609 159 aa12.83□□□□□ -0.36
BRPF3-210ENST00000532538 IGF2P01344 180 aa12.83□□□□□ -0.36
BRPF3-210ENST00000532538 IGHV2-70P01814 119 aa12.83□□□□□ -0.36
BRPF3-210ENST00000532538 IGHMP01871 453 aa12.83□□□□□ -0.36
BRPF3-210ENST00000532538 CD55P08174 381 aa12.83□□□□□ -0.36
BRPF3-210ENST00000532538 HKR1P10072 659 aa12.83□□□□□ -0.36
BRPF3-210ENST00000532538 CRYBA2P53672 197 aa12.83□□□□□ -0.36
BRPF3-210ENST00000532538 SCRN3Q0VDG4 424 aa12.83□□□□□ -0.36
BRPF3-210ENST00000532538 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP12.83□□□□□ -0.36
BRPF3-210ENST00000532538 PSG7Q13046 419 aa12.83□□□□□ -0.36
BRPF3-210ENST00000532538 ZNF154Q13106 437 aa12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.2 ms