RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 GLB1L2Q8IW92 636 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 PROKR2Q8NFJ6 384 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 SLC26A10Q8NG04 563 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 RFKQ969G6 155 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 Q96MT0 163 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 FOXB1Q99853 325 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 NELFAQ9H3P2 528 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 TMEM38BQ9NVV0 291 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 CLN6Q9NWW5 311 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 HAO2Q9NYQ3 351 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 SH3D21A4FU49 640 aa14.72□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 SLC22A31A6NKX4 558 aa14.72□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 HTR1FP30939 366 aa14.72□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 CD79BP40259 229 aa14.72□□□□□ -0.05
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PACS1-208ENST00000529677 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
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PACS1-208ENST00000529677 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa14.72□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 LCN1P1Q5VSP4 162 aa14.72□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 STAC2Q6ZMT1 411 aa14.72□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 LUZP2Q86TE4 346 aa14.72□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 OR1K1Q8NGR3 316 aa14.72□□□□□ -0.05
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PACS1-208ENST00000529677 TEAD3Q99594 435 aa14.72□□□□□ -0.05
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PACS1-208ENST00000529677 POLE4Q9NR33 117 aa14.72□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 AASSQ9UDR5 926 aa14.72□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 TFP02787 698 aa14.71□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 NPR2P20594 1047 aa14.71□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 CDH11P55287 796 aa14.71□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 TGFBR3Q03167 851 aa14.71□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 HSF2Q03933 536 aa14.71□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 GABRA6Q16445 453 aa14.71□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 PCK2Q16822 640 aa14.71□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 FAM27BQ5VT28 67 aa14.71□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 ANKRD16Q6P6B7 361 aa14.71□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 C17orf78Q8N4C9 275 aa14.71□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 CNIH3Q8TBE1 160 aa14.71□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 OTULINQ96BN8 352 aa14.71□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 OR51V1Q9H2C8 321 aa14.71□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 SIAEQ9HAT2 523 aa14.71□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa14.71□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 GALNT8Q9NY28 637 aa14.71□□□□□ -0.05
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PACS1-208ENST00000529677 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 A0A1W2PPL8 197 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 SNTNA6NMZ2 147 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 SCG5P05408 212 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 MSR1P21757 451 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 GSTT1P30711 240 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 FMO3P31513 532 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 CCKARP32238 428 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 CXCR4P61073 352 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 LSM6P62312 80 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 KLHL12Q53G59 568 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 TEX30Q5JUR7 227 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 OR7E24Q6IFN5 339 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 ZNF813Q6ZN06 617 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 TIGD4Q8IY51 512 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 SLC22A24Q8N4F4 322 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 OR51L1Q8NGJ5 315 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
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PACS1-208ENST00000529677 WACQ9BTA9 647 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 HDHD5Q9BXW7 423 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 RERGLQ9H628 205 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 UBAP1Q9NZ09 502 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 HIVEP2P31629 2446 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 FAM171A2A8MVW0 826 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 INAFM1C9JVW0 142 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 LYZL6O75951 148 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 GPANK1O95872 356 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 CST2P09228 141 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 B4GALT1P15291 398 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 CDAP32320 146 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 SLC15A1P46059 708 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 ZNF91Q05481 1191 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 C6orf141Q5SZD1 244 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 C9orf135Q5VTT2 229 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 LYPD4Q6UWN0 246 aa14.69□□□□□ -0.06
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