RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 SDF2Q99470 211 aa3.66□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 RHOXF2Q9BQY4 288 aa3.66□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 KATNB1Q9BVA0 655 aa3.66□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 KLHL4Q9C0H6 718 aa3.66□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 UBTD1Q9HAC8 227 aa3.66□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 MEAF6Q9HAF1 191 aa3.66□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 A4GALTQ9NPC4 353 aa3.66□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 EQTNQ9NQ60 294 aa3.66□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 TUBG2Q9NRH3 451 aa3.66□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 CBLN4Q9NTU7 201 aa3.66□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa3.66□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 MED11Q9P086 117 aa3.66□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 VDAC3Q9Y277 283 aa3.66□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 TIMM22Q9Y584 194 aa3.66□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 GMEB1Q9Y692 573 aa3.66□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 CSMD2Q7Z408 3487 aa3.66□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 NAV3Q8IVL0 2385 aa3.66□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 A0A0G2JPF8 293 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 A8MVM7 634 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 DEFB108AA8MXU0 73 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 EVPLLA8MZ36 301 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF587BE7ETH6 402 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 RFXANKO14593 260 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 TNFSF11O14788 317 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 PLPP2O43688 288 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 CD5LO43866 347 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 CXCL13O43927 109 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 FMO6PO60774 539 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 PEX11AO75192 247 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 KRT33AO76009 404 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 AQP8O94778 261 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ANP32DO95626 131 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 NPPAP01160 153 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 IGF2P01344 180 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 IFNA14P01570 189 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 LINC00032P0C843 101 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ETS2P15036 469 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ANPEPP15144 967 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 CXCR1P25024 350 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 SLCO1A2P46721 670 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 AMTP48728 403 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 PPOXP50336 477 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 CCR4P51679 360 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 SIRPAP78324 504 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 KCNJ10P78508 379 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF117Q03924 483 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 LTBQ06643 244 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 RBBP4Q09028 425 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 MERTKQ12866 999 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 FOXF1Q12946 379 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 STX3Q13277 289 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 SKP2Q13309 424 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 SQLEQ14534 574 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 CASP8Q14790 479 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 QPRTQ15274 297 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 RAB35Q15286 201 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 UGT3A2Q3SY77 523 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 KRT71Q3SY84 523 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 CHRFAM7AQ494W8 412 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ANKDD1AQ495B1 522 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 HHATQ5VTY9 493 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 IL23RQ5VWK5 629 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 SAXO2Q658L1 398 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 OR5M10Q6IEU7 315 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 C6orf120Q7Z4R8 191 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF614Q8N883 585 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 LSMEM1Q8N8F7 131 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 OR4A15Q8NGL6 344 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 BBS10Q8TAM1 723 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 LINC01560Q8TB33 94 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 TCP10LQ8TDR4 215 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ZFAND2BQ8WV99 257 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 SLC38A4Q969I6 547 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ROPN1LQ96C74 230 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 PGAM5Q96HS1 289 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 LRR1Q96L50 414 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 MUS81Q96NY9 551 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 OR5B2Q96R09 309 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 GFI1Q99684 422 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 SH3GL1Q99961 368 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 DHRS9Q9BPW9 319 aa3.65□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC106Q9BWC9 280 aa3.65□□□□□ -1.83
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