RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520166.5

TSNARE1-205, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,742 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-205ENST00000520166 RER1O15258 196 aa14.92□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 OR2T7P0C7T2 308 aa14.92□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 BMP5P22003 454 aa14.92□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 CA7P43166 264 aa14.92□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 ZNF84P51523 738 aa14.92□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 GP2P55259 537 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 TUBA1BP68363 451 aa14.92□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 TUBA4AP68366 448 aa14.92□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 POU4F2Q12837 409 aa14.92□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 TUBA1AQ71U36 451 aa14.92□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 DCXRQ7Z4W1 244 aa14.92□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 ZFP41Q8N8Y5 198 aa14.92□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 OR2T27Q8NH04 317 aa14.92□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 FNDC8Q8TC99 324 aa14.92□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 ABHD6Q9BV23 337 aa14.92□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa14.92□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa14.92□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 ZNF224Q9NZL3 707 aa14.92□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 MALT1Q9UDY8 824 aa14.92□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa14.92□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 MEMO1Q9Y316 297 aa14.92□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 RTTNQ86VV8 2226 aa14.92□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 J3QLW9 94 aa14.92□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 LYZL6O75951 148 aa14.92□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 ZNF19P17023 458 aa14.92□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 CTSSP25774 331 aa14.92□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 TLE1Q04724 770 aa14.92□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 GALEQ14376 348 aa14.92□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 KCNMB1Q16558 191 aa14.92□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 PCK2Q16822 640 aa14.92□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 HIKESHIQ53FT3 197 aa14.92□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 SLC18B1Q6NT16 456 aa14.92□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 ZNF813Q6ZN06 617 aa14.92□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 LUZP2Q86TE4 346 aa14.92□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 SLC22A24Q8N4F4 322 aa14.92□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 ST7LQ8TDW4 575 aa14.92□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 YIPF3Q9GZM5 350 aa14.92□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 LAMP5Q9UJQ1 280 aa14.92□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa14.92□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa14.92□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 A0A1W2PR80 420 aa14.91□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 C1QL1O75973 258 aa14.91□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 HRGP04196 525 aa14.91□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 OR8G3PP0DMU2 310 aa14.91□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 MYL12AP19105 171 aa14.91□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 MSR1P21757 451 aa14.91□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 GNLYP22749 145 aa14.91□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 ANOS1P23352 680 aa14.91□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 PSMB10P40306 273 aa14.91□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 MED22Q15528 200 aa14.91□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 C11orf91Q3C1V1 193 aa14.91□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 ZNF684Q5T5D7 378 aa14.91□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 LRRN1Q6UXK5 716 aa14.91□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 SATL1Q86VE3 508 aa14.91□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 OR10H5Q8NGA6 315 aa14.91□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 C4orf36Q96KX1 117 aa14.91□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 CDADC1Q9BWV3 514 aa14.91□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 JAM3Q9BX67 310 aa14.91□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 NOX3Q9HBY0 568 aa14.91□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 PROCRQ9UNN8 238 aa14.91□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 ERGIC3Q9Y282 383 aa14.91□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 IRGMA1A4Y4 181 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 CCL21O00585 134 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 HSMCR30P0CW71 290 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 ALDH3B2P48448 385 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 TEX30Q5JUR7 227 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 FAM27BQ5VT28 67 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 RNLSQ5VYX0 342 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 FJX1Q86VR8 437 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 GABRG1Q8N1C3 465 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 MUL1Q969V5 352 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 SIAEQ9HAT2 523 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 PRR14LQ5THK1 2151 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-205ENST00000520166 DPPA5A6NC42 116 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 E9PLN8 166 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 RAD51DO75771 328 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 HLA-HP01893 362 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 NR2C1P13056 603 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 MPGP29372 298 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 RPL5P46777 297 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 BLVRAP53004 296 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 NR1H2P55055 460 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 CDSNQ15517 529 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 Q6ZT83 130 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-205ENST00000520166 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.5 ms