RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518290.1

ARFGEF1-204, Transcript of ADP ribosylation factor guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene ARFGEF1, Length 3,179 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1-204ENST00000518290 PIGQQ9BRB3 760 aa7.14□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 COMMD4Q9H0A8 199 aa7.14□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 CDCP1Q9H5V8 836 aa7.14□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 ZNF160Q9HCG1 818 aa7.14□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 TMEM9BQ9NQ34 198 aa7.14□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 DMDP11532 3685 aa7.13□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa7.13□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 ZNF814B7Z6K7 855 aa7.13□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 H7C1C5 153 aa7.13□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 GLSO94925 669 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 OR6A2O95222 327 aa7.13□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 IGHG1P01857 330 aa7.13□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 CNR1P21554 472 aa7.13□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 CD96P40200 585 aa7.13□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 LCN6P62502 163 aa7.13□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 C19orf57Q0VDD7 668 aa7.13□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 P2RY14Q15391 338 aa7.13□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa7.13□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 ZNF627Q7L945 461 aa7.13□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 UEVLDQ8IX04 471 aa7.13□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 Q8N402 240 aa7.13□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 YIPF7Q8N8F6 280 aa7.13□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 PLPP7Q8NBV4 271 aa7.13□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 OR4K17Q8NGC6 315 aa7.13□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 OR6N2Q8NGY6 317 aa7.13□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 SMIM4Q8WVI0 70 aa7.13□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa7.13□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 FOXJ2Q9P0K8 574 aa7.13□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 KCNN3Q9UGI6 736 aa7.13□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 V9GY05 133 aa7.13□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 A0A0A6YYH2 397 aa7.13□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 A6NJ64 397 aa7.13□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 AHCYP23526 432 aa7.13□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 OLFML2AQ68BL7 652 aa7.13□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 ZNF544Q6NX49 715 aa7.13□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 CREB3L2Q70SY1 520 aa7.13□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 LINGO2Q7L985 606 aa7.13□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 C20orf196Q8IYI0 205 aa7.13□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 OR1J4Q8NGS1 313 aa7.13□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 ASB5Q8WWX0 329 aa7.13□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 CREB3L1Q96BA8 519 aa7.13□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 HAVCR1Q96D42 359 aa7.13□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 OR2M2Q96R28 347 aa7.13□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 C12orf4Q9NQ89 552 aa7.13□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 PLSCR3Q9NRY6 295 aa7.13□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 LHFPL6Q9Y693 200 aa7.13□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa7.13□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 C11orf98E9PRG8 122 aa7.12□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 CCNKO75909 580 aa7.12□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 WNT11O96014 354 aa7.12□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 PNPP00491 289 aa7.12□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 CTRB1P17538 263 aa7.12□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 DDOSTP39656 456 aa7.12□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 RIDAP52758 137 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 CDK10Q15131 360 aa7.12□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 MEP1BQ16820 701 aa7.12□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 ELFN2Q5R3F8 820 aa7.12□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 CTRB2Q6GPI1 263 aa7.12□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 NRARPQ7Z6K4 114 aa7.12□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 RAB43Q86YS6 212 aa7.12□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 ZIC4Q8N9L1 334 aa7.12□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 YIPF5Q969M3 257 aa7.12□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 SLC25A36Q96CQ1 311 aa7.12□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 EMC3Q9P0I2 261 aa7.12□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 COMMD3Q9UBI1 195 aa7.12□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa7.12□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 A0A0G2JMP0 313 aa7.12□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 A0A0X1KG70 313 aa7.12□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 OR2M5A3KFT3 312 aa7.12□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 RGS5O15539 181 aa7.12□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 GABRA1P14867 456 aa7.12□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 M6PRP20645 277 aa7.12□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 PSMB10P40306 273 aa7.12□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 RAC3P60763 192 aa7.12□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 ADAM8P78325 824 aa7.12□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 MELKQ14680 651 aa7.12□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 IDNKQ5T6J7 187 aa7.12□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 NKAIN3Q8N8D7 197 aa7.12□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 OR5H6Q8NGV6 325 aa7.12□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
ARFGEF1-204ENST00000518290 SMOC1Q9H4F8 434 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.3 ms