RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SAMD10Q9BYL1 202 aa-0.38□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM117Q9H0C3 514 aa-0.38□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATG10Q9H0Y0 220 aa-0.38□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DPH5Q9H2P9 285 aa-0.38□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa-0.38□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SUN2Q9UH99 717 aa-0.38□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AURKCQ9UQB9 309 aa-0.38□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa-0.38□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MEMO1Q9Y316 297 aa-0.38□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR10H1Q9Y4A9 318 aa-0.38□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HYOU1Q9Y4L1 999 aa-0.38□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KDRP35968 1356 aa-0.38□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa-0.38□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FSIP2Q5CZC0 6907 aa-0.38□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ROS1P08922 2347 aa-0.38□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DOCK6Q96HP0 2047 aa-0.38□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UBE4BO95155 1302 aa-0.38□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MYO9BQ13459 2157 aa-0.39□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A0B4J2A0 478 aa-0.39□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa-0.39□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARHGAP42A6NI28 874 aa-0.39□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR5B21A6NL26 309 aa-0.39□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A8MXQ7 604 aa-0.39□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KRBOX1C9JBD0 128 aa-0.39□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 D6RAR5 112 aa-0.39□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR7C2O60412 319 aa-0.39□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATP5LO75964 103 aa-0.39□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AP2A1O95782 977 aa-0.39□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGHV2-5P01817 119 aa-0.39□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGHG2P01859 326 aa-0.39□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRH1P02810 166 aa-0.39□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PAX7P23759 505 aa-0.39□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP-0.39□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HCAR3P49019 387 aa-0.39□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NAPAP54920 295 aa-0.39□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCL23P55773 120 aa-0.39□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP-0.39□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CDK16Q00536 496 aa-0.39□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPA4Q13156 261 aa-0.39□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HES1Q14469 280 aa-0.39□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MORF4L2Q15014 288 aa-0.39□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CHRNA6Q15825 494 aa-0.39□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KLHL38Q2WGJ6 581 aa-0.39□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LUZP6Q538Z0 58 aa-0.39□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SOHLH1Q5JUK2 328 aa-0.39□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LIN9Q5TKA1 542 aa-0.39□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IYDQ6PHW0 289 aa-0.39□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MISPQ8IVT2 679 aa-0.39□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 METTL13Q8N6R0 699 aa-0.39□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZFP41Q8N8Y5 198 aa-0.39□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR52B4Q8NGK2 314 aa-0.39□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PYROXD1Q8WU10 500 aa-0.39□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM186Q96B77 213 aa-0.39□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GPR82Q96P67 336 aa-0.39□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RSG1Q9BU20 258 aa-0.39□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ACAT2Q9BWD1 397 aa-0.39□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C2orf40Q9H1Z8 148 aa-0.39□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UFSP2Q9NUQ7 469 aa-0.39□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATXN10Q9UBB4 475 aa-0.39□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MTRRQ9UBK8 725 aa-0.39□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SHPKQ9UHJ6 478 aa-0.39□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa-0.4□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa-0.4□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BTN3A3O00478 584 aa-0.4□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF208O43345 1280 aa-0.4□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TM7SF2O76062 418 aa-0.4□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CDS2O95674 445 aa-0.4□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AIFM1O95831 613 aa-0.4□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGHMP01871 453 aa-0.4□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CD3GP09693 182 aa-0.4□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IMPDH1P20839 514 aa-0.4□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP-0.4□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FOXA1P55317 472 aa-0.4□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP-0.4□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KLRC3Q07444 240 aa-0.4□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PJVKQ0ZLH3 352 aa-0.4□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KLRB1Q12918 225 aa-0.4□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BIKQ13323 160 aa-0.4□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TSC22D1Q15714 1073 aa-0.4□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CATSPER4Q7RTX7 472 aa-0.4□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ECHDC2Q86YB7 292 aa-0.4□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCDC65Q8IXS2 484 aa-0.4□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC38A6Q8IZM9 456 aa-0.4□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR4M1Q8NGD0 313 aa-0.4□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KRT35Q92764 455 aa-0.4□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OTUB2Q96DC9 234 aa-0.4□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP-0.4□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NSMCE2Q96MF7 247 aa-0.4□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR8B4Q96RC9 309 aa-0.4□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP-0.4□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SMR3AQ99954 134 aa-0.4□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ABCG5Q9H222 651 aa-0.4□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZWILCHQ9H900 591 aa-0.4□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IL37Q9NZH6 218 aa-0.4□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ST3GAL6Q9Y274 331 aa-0.4□□□□□ -2.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR51B4Q9Y5P0 310 aa-0.4□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.6 ms