RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	NAT6	Q93015	286 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	RNF32	Q9H0A6	362 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	METTL9	Q9H1A3	318 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1B0GTH9	108 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	ZFPL1	O95159	310 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	HSF1	Q00613	529 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	NR0B2	Q15466	257 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	GPR119	Q8TDV5	335 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	C8orf44	Q96CB5	159 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	OR2A5	Q96R48	311 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	FKRP	Q9H9S5	495 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	ENY2	Q9NPA8	101 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	ALOX12B	O75342	701 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	MSX1	P28360	303 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	PLA2G7	Q13093	441 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	SLC17A1	Q14916	467 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	FXN	Q16595	210 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	BATF2	Q8N1L9	274 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	RADIL	Q96JH8	1075 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF285	Q96NJ3	590 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	LRFN1	Q9P244	771 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	KCND3	Q9UK17	655 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193		A0A087WUJ7	227 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193		A0A0B4J2E0	115 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1B0GX12	115 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	PRSS37	A4D1T9	235 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	STMND1	H3BQB6	276 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	BPNT1	O95861	308 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	ACHE	P22303	614 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	CPT2	P23786	658 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	MESP2	Q0VG99	397 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	UPRT	Q96BW1	309 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	GPA33	Q99795	319 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	CDH20	Q9HBT6	801 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	OR6C68	A6NDL8	312 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	NKX2-2	O95096	273 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	TK1	P04183	234 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	WNT1	P04628	370 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	MYF5	P13349	255 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	ALOX5AP	P20292	161 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	SLC35A1	P78382	337 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	DOC2B	Q14184	412 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	ACTBL2	Q562R1	376 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	MDGA2	Q7Z553	956 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	FJX1	Q86VR8	437 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	NT5C	Q8TCD5	201 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	COX14	Q96I36	57 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF576	Q9H609	170 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	CACNA1E	Q15878	2313 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	PLPP2	O43688	288 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	RGS11	O94810	467 aa		7.31	□□□□□ -1.24

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