RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 RFX4Q33E94 735 aa16.05■□□□□ 0.16
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SH3BP2-218ENST00000511185 OR8D4Q8NGM9 314 aa16.05■□□□□ 0.16
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SH3BP2-218ENST00000511185 SLC25A16P16260 332 aa16.03■□□□□ 0.16
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SH3BP2-218ENST00000511185 AQP11Q8NBQ7 271 aa16.03■□□□□ 0.16
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SH3BP2-218ENST00000511185 OR2T29Q8NH02 315 aa16.02■□□□□ 0.16
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SH3BP2-218ENST00000511185 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
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SH3BP2-218ENST00000511185 IFNGR2P38484 337 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 EVX1P49640 407 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 GGTLC2Q14390 218 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM249Q2WGJ8 235 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 PGM2L1Q6PCE3 622 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
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