RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 PGA4P0DJD7 388 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 PGA3P0DJD8 388 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 CD37P11049 281 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF823P16415 610 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 ADRA2CP18825 462 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 KLK2P20151 261 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 CFPP27918 469 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 CD97P48960 835 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 GPR85P60893 370 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 RPS15P62841 145 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 KCNMB1Q16558 191 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 ACER2Q5QJU3 275 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 THEM4Q5T1C6 240 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 PYHIN1Q6K0P9 492 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 MDGA2Q7Z553 956 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 KRT77Q7Z794 578 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 GLB1L2Q8IW92 636 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 UBQLNLQ8IYU4 475 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 GPR148Q8TDV2 347 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 THRSPQ92748 146 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 ABHD1Q96SE0 405 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 WACQ9BTA9 647 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 B3GNT4Q9C0J1 378 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC22A4Q9H015 551 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 COMMD4Q9H0A8 199 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC22A13Q9Y226 551 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 R4GMQ9 66 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 V9GY05 133 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 ATRXP46100 2492 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 PKD1L2Q7Z442 2459 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 C21orf140B9A014 251 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 G3V3Y1 287 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 SULT2B1O00204 365 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC43A1O75387 559 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 IGHG1P01857 330 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 LAP3P28838 519 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 SRD5A2P31213 254 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 SFTPDP35247 375 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 NR4A2P43354 598 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 KIR2DL3P43628 341 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 SOX2P48431 317 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 PITPNBP48739 271 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 RIDAP52758 137 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 RAC1P63000 192 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 CD300CQ08708 224 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 MADCAM1Q13477 382 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 POU4F3Q15319 338 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 HDDC2Q7Z4H3 204 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 DCXRQ7Z4W1 244 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF676Q8N7Q3 588 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 DUSP18Q8NEJ0 188 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 NOXO1Q8NFA2 376 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 RNF133Q8WVZ7 376 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 TRIM63Q969Q1 353 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 PPP1R14AQ96A00 147 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 MRI1Q9BV20 369 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC25A18Q9H1K4 315 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 G6PC2Q9NQR9 355 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 CAMK2AQ9UQM7 478 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 LRP12Q9Y561 859 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 ALPK2Q86TB3 2170 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 ZZEF1O43149 2961 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A0G2JMM0 328 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A0J9YW62 118 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A1W2PPB8 328 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A1W2PRS3 328 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 LRRC3CA6NJW4 275 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 TTLL8A6PVC2 850 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 KIR3DP1A8MWS1 328 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 LANCL1O43813 399 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 UBL3O95164 117 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 ISG15P05161 165 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 CALCBP10092 127 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 DCTDP32321 178 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 TALDO1P37837 337 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 MAP2K3P46734 347 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 DNASE1L1P49184 302 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 MFAP5Q13361 173 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 CAMK2BQ13554 666 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 CAMK2DQ13557 499 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM164Q5U3C3 297 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 AGAP6Q5VW22 663 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 HACD4Q5VWC8 232 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 TRIQKQ629K1 86 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM225Q6GV28 225 aa9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.1 ms