RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498054.1

POLR1B-215, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1B, Length 636 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-215ENST00000498054 NUDT15Q9NV35 164 aa3.13□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 IL17CQ9P0M4 197 aa3.13□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 SUN2Q9UH99 717 aa3.13□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 CDH9Q9ULB4 789 aa3.13□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 COPS3Q9UNS2 423 aa3.13□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 ERVW-1Q9UQF0 538 aa3.13□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 RASD1Q9Y272 281 aa3.13□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 IFT52Q9Y366 437 aa3.13□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa3.13□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 AGRNO00468 2067 aa3.13□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 ANK1P16157 1881 aa3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 TRDCB7Z8K6 153 aa3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 E9PBE3 544 aa3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 BIRC5O15392 142 aa3.12□□□□□ -1.91
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POLR1B-215ENST00000498054 CXCL13O43927 109 aa3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 CCDC22O60826 627 aa3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 ATP5LO75964 103 aa3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 DIRAS1O95057 198 aa3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 LYPD3O95274 346 aa3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 DBTP11182 482 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 ATP6V1B2P21281 511 aa3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 GNA11P29992 359 aa3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 HTR1FP30939 366 aa3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 RBMXP38159 391 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 SERPINB8P50452 374 aa3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 PKNOX1P55347 436 aa3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 XIAPP98170 497 aa3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 TMED1Q13445 227 aa3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 BCL2A1Q16548 175 aa3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 DPYSL2Q16555 572 aa3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 MAJINQ3KP22 176 aa3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 SPATA46Q5T0L3 261 aa3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF544Q6NX49 715 aa3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 NLRP9Q7RTR0 991 aa3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 PPP1R27Q86WC6 154 aa3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 BBS5Q8N3I7 341 aa3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 DNAJB3Q8WWF6 145 aa3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 ST8SIA1Q92185 356 aa3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 FGF11Q92914 225 aa3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 FGF14Q92915 247 aa3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 CATSPER2Q96P56 530 aa3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 SMIM14Q96QK8 99 aa3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 PSKH2Q96QS6 385 aa3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 TSG101Q99816 390 aa3.12□□□□□ -1.91
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POLR1B-215ENST00000498054 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 GON7Q9BXV9 100 aa3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 NT5C3AQ9H0P0 336 aa3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 INIPQ9NRY2 104 aa3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 PLSCR3Q9NRY6 295 aa3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 ETNK2Q9NVF9 386 aa3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 FAIMQ9NVQ4 179 aa3.12□□□□□ -1.91
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POLR1B-215ENST00000498054 TAS2R1Q9NYW7 299 aa3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 TREM2Q9NZC2 230 aa3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 ATG2BQ96BY7 2078 aa3.12□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 CSMD2Q7Z408 3487 aa3.12□□□□□ -1.91
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POLR1B-215ENST00000498054 CEP192Q8TEP8 1941 aa3.11□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 SPTA1P02549 2419 aa3.11□□□□□ -1.91
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POLR1B-215ENST00000498054 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 HDAC3O15379 428 aa3.11□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 MED7O43513 233 aa3.11□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 DENRO43583 198 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 CDH16O75309 829 aa3.11□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 SERPINB7O75635 380 aa3.11□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 AP2A1O95782 977 aa3.11□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF24P17028 368 aa3.11□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 GRIA1P42261 906 aa3.11□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 SLCO1A2P46721 670 aa3.11□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 CASP4P49662 377 aa3.11□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 ACTR3P61158 418 aa3.11□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 CSNK1G2P78368 415 aa3.11□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 NDPQ00604 133 aa3.11□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF45Q02386 682 aa3.11□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 CAV1Q03135 178 aa3.11□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 C1orf61Q13536 156 aa3.11□□□□□ -1.91
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