RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496549.5

CRNKL1-205, Transcript of crooked neck pre-mRNA splicing factor 1, human

TSL 1 (best)

Gene CRNKL1, Length 4,093 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRNKL1-205	ENST00000496549	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	BET1L	Q9NYM9	111 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	RNF24	Q9Y225	148 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF320	A2RRD8	509 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC16A8	O95907	504 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	TK1	P04183	234 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	GPR89B	P0CG08	455 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	BCKDHB	P21953	392 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	CDKN1B	P46527	198 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC35A1	P78382	337 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	NFATC2	Q13469	925 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	EIPR1	Q53HC9	387 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR1P1	Q8NH06	330 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	PCED1B	Q96HM7	432 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR52D1	Q9H346	318 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	MED20	Q9H944	212 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	ADAP2	Q9NPF8	381 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	IDS	B3KWA1	339 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	GFY	I3L273	518 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRPH2	P23942	346 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	THBS2	P35442	1172 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	PSMB10	P40306	273 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	MAPK8	P45983	427 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	SP3	Q02447	781 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	RING1	Q06587	406 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	GPX8	Q8TED1	209 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	NEIL2	Q969S2	332 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	SERINC2	Q96SA4	455 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	NXPH2	O95156	264 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	OPN1MW	P04001	364 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	LPAR6	P43657	344 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	GNMT	Q14749	295 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	CDK5R1	Q15078	307 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	LCN10	Q6JVE6	187 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	CFAP161	Q6P656	301 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	LMF1	Q96S06	567 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	PCBD2	Q9H0N5	130 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	MED31	Q9Y3C7	131 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	NUP98	P52948	1817 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549		B4DEV8	164 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF28	P17035	718 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	FCGR2C	P31995	323 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC7A9	P82251	487 aa		7.47	□□□□□ -1.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms