RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 IGFL3Q6UXB1 125 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 SLC30A8Q8IWU4 369 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 GPR148Q8TDV2 347 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 PHYHIPLQ96FC7 376 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 IP6K3Q96PC2 410 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 OR6C1Q96RD1 312 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 OCSTAMPQ9BR26 566 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 PIGQQ9BRB3 760 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 SEC11CQ9BY50 192 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 MFFQ9GZY8 342 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 APMAPQ9HDC9 416 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 TAC3Q9UHF0 121 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 RARRES3Q9UL19 164 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 STARD10Q9Y365 291 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 SPEGQ15772 3267 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 NPIPB9F8W1W9 429 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 H3BN98 237 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ITGB1BP1O14713 200 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 CHST10O43529 356 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 PCDH7O60245 1069 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 STK17BO94768 372 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 OR12D1P0DN82 309 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 HTR2AP28223 471 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 RPL3P39023 403 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 PMELP40967 661 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 PKIAP61925 76 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 CDK6Q00534 326 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 SLC9A5Q14940 896 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 TGIF1Q15583 401 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 SFXN4Q6P4A7 337 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 C17orf64Q86WR6 236 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 CLECL1Q8IZS7 167 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 OR13C3Q8NGS6 347 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 XAGE5Q8WWM1 108 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 RNFT2Q96EX2 444 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 CMTM7Q96FZ5 175 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 HRASLSQ9HDD0 168 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 TVP23BQ9NYZ1 205 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 OR6C76A6NM76 312 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 MCIDASD6RGH6 385 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 FAM227AF5H4B4 570 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 TNFSF15O95150 251 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 C1QTNF9P0C862 333 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 SLC2A1P11166 492 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 CELP19835 753 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 H2BFSP57053 126 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ABHD17CQ6PCB6 329 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 NUP54Q7Z3B4 507 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 THNSL2Q86YJ6 484 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 OR1S2Q8NGQ3 325 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 SMIM4Q8WVI0 70 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 OSTF1Q92882 214 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 MED8Q96G25 268 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 PLEKHA1Q9HB21 404 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 KIF26BQ2KJY2 2108 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ZNF879B4DU55 563 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 DVL2O14641 736 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 PDYNP01213 254 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 AMD1P17707 334 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 BDKRB2P30411 391 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 PNLIPRP2P54317 469 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 IL10RAQ13651 578 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 LINC00303Q3SY05 128 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 OR52W1Q6IF63 320 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 OR2W3Q7Z3T1 314 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 CDK20Q8IZL9 346 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ASB13Q8WXK3 278 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ZFP3Q96NJ6 502 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 AIF1LQ9BQI0 150 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 NOX3Q9HBY0 568 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 CUTCQ9NTM9 273 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 MED17Q9NVC6 651 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 SERTAD3Q9UJW9 196 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 CAMK2AQ9UQM7 478 aa6.92□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 A0A0G2JK05 382 aa6.91□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 NUDT19A8MXV4 375 aa6.91□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 FFAR1O14842 300 aa6.91□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 PRODHO43272 600 aa6.91□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ZNF35P13682 527 aa6.91□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 TBXA2RP21731 343 aa6.91□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ACHEP22303 614 aa6.91□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 CDKN1BP46527 198 aa6.91□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
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