RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484897.3

RPSAP58-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 58, humanhuman

BASIC

Gene RPSAP58, Length 888 nt, Biotype processed pseudogene, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP58-201ENST00000484897 PGBD2Q6P3X8 592 aa9.55□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa9.55□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa9.55□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa9.55□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 ARHGAP24Q8N264 748 aa9.55□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 OR1J1Q8NGS3 322 aa9.55□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa9.55□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 LRGUKQ96M69 825 aa9.55□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 TSSK2Q96PF2 358 aa9.55□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 PIMREGQ9BSJ6 248 aa9.55□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 IFT27Q9BW83 186 aa9.55□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 FN3KQ9H479 309 aa9.55□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 REV1Q9UBZ9 1251 aa9.55□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 METRNQ9UJH8 293 aa9.55□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa9.55□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 U3KQV3 271 aa9.55□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa9.55□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 SNAP29O95721 258 aa9.54□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 FPR3P25089 353 aa9.54□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 SLC6A6P31641 620 aa9.54□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 IFNGR2P38484 337 aa9.54□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 WNT5AP41221 380 aa9.54□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 GSSP48637 474 aa9.54□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 UCP2P55851 309 aa9.54□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 PCBD1P61457 104 aa9.54□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 NKPD1Q17RQ9 610 aa9.54□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 RFX4Q33E94 735 aa9.54□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa9.54□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 C1orf94Q6P1W5 598 aa9.54□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 LEG1Q6P5S2 330 aa9.54□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 JAZF1Q86VZ6 243 aa9.54□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 ZNF101Q8IZC7 436 aa9.54□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 OR4K13Q8NH42 304 aa9.54□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 ABHD4Q8TB40 342 aa9.54□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 SYNPRQ8TBG9 265 aa9.54□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 POM121L2Q96KW2 1035 aa9.54□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 NMNAT3Q96T66 252 aa9.54□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 BTBD10Q9BSF8 475 aa9.54□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 NUAK2Q9H093 628 aa9.54□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 MUC13Q9H3R2 512 aa9.54□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 EGLN3Q9H6Z9 239 aa9.54□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 YAE1D1Q9NRH1 226 aa9.54□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 VNN3Q9NY84 501 aa9.54□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 TAAR3PQ9P1P4 343 aa9.54□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa9.54□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa9.53□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 C12orf71A8MTZ7 269 aa9.53□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 DCTN6O00399 190 aa9.53□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 DOK2O60496 412 aa9.53□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 KRT36O76013 467 aa9.53□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 CCNB2O95067 398 aa9.53□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 STAMBPO95630 424 aa9.53□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 USF1P22415 310 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 NOS3P29474 1203 aa9.53□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 RAD52P43351 418 aa9.53□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 NR4A2P43354 598 aa9.53□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 MAGEA2P43356 314 aa9.53□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 HTR5AP47898 357 aa9.53□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 EVX1P49640 407 aa9.53□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 ERFP50548 548 aa9.53□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 SELENOVP59797 346 aa9.53□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 TSPAN31Q12999 210 aa9.53□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 MEP1BQ16820 701 aa9.53□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 TMEM249Q2WGJ8 235 aa9.53□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa9.53□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 ZNF620Q6ZNG0 422 aa9.53□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa9.53□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 ADCK1Q86TW2 530 aa9.53□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 GLB1L2Q8IW92 636 aa9.53□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa9.53□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 SDR9C7Q8NEX9 313 aa9.53□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 OR4C15Q8NGM1 316 aa9.53□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 UBASH3BQ8TF42 649 aa9.53□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 C11orf40Q8WZ69 217 aa9.53□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 SLC7A6Q92536 515 aa9.53□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 ASB9Q96DX5 294 aa9.53□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 BCL2L14Q9BZR8 327 aa9.53□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 BPESC1Q9GZL8 116 aa9.53□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 C1orf21Q9H246 121 aa9.53□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 MAGIXQ9H6Y5 334 aa9.53□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 POLR1DQ9Y2S0 133 aa9.53□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
RPSAP58-201ENST00000484897 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa9.52□□□□□ -0.89
RPSAP58-201ENST00000484897 VWC2LB2RUY7 222 aa9.52□□□□□ -0.89
RPSAP58-201ENST00000484897 GYG2O15488 501 aa9.52□□□□□ -0.89
RPSAP58-201ENST00000484897 SGCEO43556 437 aa9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms