RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470268.1

SF3B1-208, Transcript of splicing factor 3b subunit 1, human

TSL 2

Gene SF3B1, Length 2,003 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SF3B1-208	ENST00000470268	ACVR2A	P27037	513 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	GGT2	P36268	569 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	TGFBR1	P36897	503 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	SELENOP	P49908	381 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	SMS	P52788	366 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	NR1H2	P55055	460 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	BID	P55957	195 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	CLDN17	P56750	224 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	FOXF2	Q12947	444 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	CAMK2D	Q13557	499 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	KEAP1	Q14145	624 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	CRMP1	Q14194	572 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	GUSBP1	Q15486	140 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	IGFBP7	Q16270	282 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	GPR107	Q5VW38	600 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	TTC23	Q5W5X9	447 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	UEVLD	Q8IX04	471 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	SPART	Q8N0X7	666 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	TMEM123	Q8N131	208 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	OR52L1	Q8NGH7	329 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	ASB10	Q8WXI3	467 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	PTP4A1	Q93096	173 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	TSSK2	Q96PF2	358 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	NMNAT3	Q96T66	252 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	FN3K	Q9H479	309 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	MED20	Q9H944	212 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	TMEM165	Q9HC07	324 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	CMC2	Q9NRP2	79 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	ZNF175	Q9Y473	711 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	MPDZ	O75970	2070 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268		A0A087WXM4	84 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268		A0A1W2PRG6	482 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	CD8B2	A6NJW9	211 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	ARHGEF9	O43307	516 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	WDR1	O75083	606 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	TNFSF13	O75888	250 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	SYNGR4	O95473	234 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	BCL10	O95999	233 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	GYPB	P06028	91 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	CCDC159	P0C7I6	412 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	PGA4	P0DJD7	388 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	PGA3	P0DJD8	388 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	GABRA1	P14867	456 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	AGTR1	P30556	359 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	GRK5	P34947	590 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	ACVR1B	P36896	505 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	UQCRFS1	P47985	274 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	PCYT1A	P49585	367 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	GZMK	P49863	264 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	TLE1	Q04724	770 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	FMOD	Q06828	376 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	4.16	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	TMED1	Q13445	227 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	ETFDH	Q16134	617 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	SNAPC1	Q16533	368 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	VWA1	Q6PCB0	445 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	ZNF773	Q6PK81	442 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SF3B1-208	ENST00000470268	AHSA2	Q719I0	299 aa		4.16	□□□□□ -1.74

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