RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 AKR7LQ8NHP1 331 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 SNX18Q96RF0 628 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF416Q9BWM5 594 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 BCL2L14Q9BZR8 327 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 OR2H1Q9GZK4 316 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 RAB1BQ9H0U4 201 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 POMPQ9Y244 141 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 ABCA1O95477 2261 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 GSC2O15499 205 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 F12P00748 615 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 GASTP01350 101 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 LCKP06239 509 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM157BP0CG42 384 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 CCNOP22674 350 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 PSG4Q00888 419 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 SCRN3Q0VDG4 424 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 DNM1P46Q6ZS02 220 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 SORCS2Q96PQ0 1159 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 DOK1Q99704 481 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 NUAK2Q9H093 628 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 EGLN3Q9H6Z9 239 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 EMC7Q9NPA0 242 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 VNN3Q9NY84 501 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 ABCA2Q9BZC7 2435 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM129A0AVI4 362 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 C5orf49A4QMS7 147 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 M0R233 179 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 SYNGR3O43761 229 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 CENPAP49450 140 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 UCP2P55851 309 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 LSM6P62312 80 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 AQP6Q13520 282 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 CLEC9AQ6UXN8 241 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF525Q8N782 197 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 ICA1LQ8NDH6 482 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 OR10G2Q8NGC3 310 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 OR4K13Q8NH42 304 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 GIPC3Q8TF64 312 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 C11orf40Q8WZ69 217 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM168AQ92567 244 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 POM121Q96HA1 1249 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 POM121L2Q96KW2 1035 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 FOXN4Q96NZ1 517 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 NMNAT3Q96T66 252 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 DGCR6LQ9BY27 220 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 REG4Q9BYZ8 158 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 RACGAP1Q9H0H5 632 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 WNT5BQ9H1J7 359 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 OR51B6Q9H340 312 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 MS4A5Q9H3V2 200 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 TBC1D23Q9NUY8 699 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 IL20Q9NYY1 176 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 GPR160Q9UJ42 338 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 POLR1DQ9Y2S0 133 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 ZANQ9Y493 2812 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 A0A1W2PPW3 197 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 ARRDC5A6NEK1 342 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 RNF223E7ERA6 249 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 DOK2O60496 412 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 E2F6O75461 281 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 COX5BP10606 129 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC25A16P16260 332 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 PDLIM4P50479 330 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 GLO1Q04760 184 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF774Q6NX45 483 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 ARL9Q6T311 187 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 UGT2A3Q6UWM9 527 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 C1orf174Q8IYL3 243 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 SDR9C7Q8NEX9 313 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 OR52E2Q8NGJ4 325 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 SYT3Q9BQG1 590 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 DUSP13Q9UII6 198 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 BAIAP2Q9UQB8 552 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 HIVEP2P31629 2446 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 BHLHE40O14503 412 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 SGCEO43556 437 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 FKBP6O75344 327 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 SCG5P05408 212 aa12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.7 ms