RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 VDAC3Q9Y277 283 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 LHFPL6Q9Y693 200 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 PTPRBP23467 1997 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 MUC6Q6W4X9 2439 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC187A0A096LP49 1063 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 A0A0B4J203 849 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 OR2M5A3KFT3 312 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 TRABD2BA6NFA1 517 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 C21orf140B9A014 251 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 NPIPA5E9PKD4 350 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 H3BML4 177 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 LDLRAD4O15165 306 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 TMCC2O75069 709 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 SERPINI2O75830 405 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 UBL3O95164 117 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 TRAPPC2P0DI81 140 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 TRAPPC2BP0DI82 140 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 CALCBP10092 127 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 CTSSP25774 331 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 SLC6A1P30531 599 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 SRD5A2P31213 254 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 DDOSTP39656 456 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 MAP2K3P46734 347 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 PTH2RP49190 550 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 MMP15P51511 669 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 CLDN15P56746 228 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 GLO1Q04760 184 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 MFAP5Q13361 173 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 SSPNQ14714 243 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 PLA1AQ53H76 456 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 THEM4Q5T1C6 240 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 C10orf128Q5T292 105 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 PRAMEF20Q5VT98 475 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 HACD4Q5VWC8 232 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 OTPQ5XKR4 325 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 PYHIN1Q6K0P9 492 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 LRFN4Q6PJG9 635 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 DNM1P34Q6PK57 102 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 LRRN1Q6UXK5 716 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 Q6ZSR3 168 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 TMPPEQ6ZT21 453 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 RHOUQ7L0Q8 258 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 GGNQ86UU5 652 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 GLB1L2Q8IW92 636 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 OR8H2Q8N162 312 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 BEST3Q8N1M1 668 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 Q8N402 240 aa5.02□□□□□ -1.61
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PTPRC-210ENST00000462363 SAMD12Q8N8I0 201 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 ZIC4Q8N9L1 334 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 OR5M1Q8NGP8 315 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 LGALS14Q8TCE9 139 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 C11orf40Q8WZ69 217 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM54Q969K7 222 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 SLC25A28Q96A46 364 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 OXGR1Q96P68 337 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 MARVELD1Q9BSK0 173 aa5.02□□□□□ -1.61
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PTPRC-210ENST00000462363 MRI1Q9BV20 369 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 STRADBQ9C0K7 418 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 OR2B2Q9GZK3 357 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 PARD6AQ9NPB6 346 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 DEPPQ9NTK1 212 aa5.02□□□□□ -1.61
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PTPRC-210ENST00000462363 P4HTMQ9NXG6 502 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 EXTL2Q9UBQ6 330 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 OR5V1Q9UGF6 321 aa5.02□□□□□ -1.61
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PTPRC-210ENST00000462363 ADAM30Q9UKF2 790 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 NPIPA1Q9UND3 350 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
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PTPRC-210ENST00000462363 R4GMQ9 66 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 R4GN57 208 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 A0A0J9YW62 118 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1B0GTI1 187 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1W2PNR3 127 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1W2PPK0 400 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 PINLYPA6NC86 204 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 FIGNL2A6NMB9 653 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF716A6NP11 495 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 PDCD5O14737 125 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-210ENST00000462363 DOK2O60496 412 aa5.01□□□□□ -1.61
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