RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 OR4Q3Q8NH05 313 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 C11orf40Q8WZ69 217 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC7A6Q92536 515 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 MCUR1Q96AQ8 359 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 POM121L2Q96KW2 1035 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 RBP7Q96R05 134 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 KCNS3Q9BQ31 491 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 SYT3Q9BQG1 590 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF416Q9BWM5 594 aa6.02□□□□□ -1.45
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RABGEF1-206ENST00000461017 REG4Q9BYZ8 158 aa6.02□□□□□ -1.45
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RABGEF1-206ENST00000461017 SYT4Q9H2B2 425 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 MUC13Q9H3R2 512 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 TPK1Q9H3S4 243 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
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RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF442Q9H7R0 627 aa6.02□□□□□ -1.45
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RABGEF1-206ENST00000461017 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 POLE4Q9NR33 117 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 GRHPRQ9UBQ7 328 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC7A8Q9UHI5 535 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 B9D1Q9UPM9 204 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 POMPQ9Y244 141 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 MTORP42345 2549 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa6.01□□□□□ -1.45
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RABGEF1-206ENST00000461017 A6NIZ1 184 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 B9A039 149 aa6.01□□□□□ -1.45
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RABGEF1-206ENST00000461017 SLC16A7O60669 478 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 NGFP01138 241 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 DBHP09172 617 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 CST2P09228 141 aa6.01□□□□□ -1.45
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RABGEF1-206ENST00000461017 NPR2P20594 1047 aa6.01□□□□□ -1.45
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RABGEF1-206ENST00000461017 ANOS1P23352 680 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 PAX7P23759 505 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 COL8A2P25067 703 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 FPR3P25089 353 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 GLRXP35754 106 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 MPV17P39210 176 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 ALDH3B1P43353 468 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 NUDT6P53370 316 aa6.01□□□□□ -1.45
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RABGEF1-206ENST00000461017 SMIM11AP58511 58 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 RAP1BP61224 184 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 RAP1AP62834 184 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 CHRNB3Q05901 458 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 RAB35Q15286 201 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 MICAQ29983 383 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 NRN1LQ496H8 165 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 SPRNQ5BIV9 151 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 MTX3Q5HYI7 312 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM205BPQ63HN1 556 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM53Q6P2H8 277 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 LEG1Q6P5S2 330 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 CLEC9AQ6UXN8 241 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF101Q8IZC7 436 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 CYB561A3Q8NBI2 242 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 AQP11Q8NBQ7 271 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 SDR9C7Q8NEX9 313 aa6.01□□□□□ -1.45
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RABGEF1-206ENST00000461017 OR4K13Q8NH42 304 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 FANK1Q8TC84 345 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 C10orf105Q8TEF2 133 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
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RABGEF1-206ENST00000461017 TRIM15Q9C019 465 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 OR2H1Q9GZK4 316 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 RERGLQ9H628 205 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 NTN4Q9HB63 628 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 FAIMQ9NVQ4 179 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 ARMC1Q9NVT9 282 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
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RABGEF1-206ENST00000461017 IL20Q9NYY1 176 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 REV1Q9UBZ9 1251 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 CMAHPQ9Y471 501 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 NAV3Q8IVL0 2385 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 C2CD3Q4AC94 2353 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 AQP12BA6NM10 295 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 VWC2LB2RUY7 222 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 ARPC3O15145 178 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 RER1O15258 196 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 SYNGR3O43761 229 aa6□□□□□ -1.45
RABGEF1-206ENST00000461017 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
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