RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458294.5

PBRM1-218, Transcript of polybromo 1, humanhuman

TSL 3

Gene PBRM1, Length 476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1-218ENST00000458294 ELOVL3Q9HB03 270 aa22.28■■□□□ 1.16
PBRM1-218ENST00000458294 NUP50Q9UKX7 468 aa22.28■■□□□ 1.16
PBRM1-218ENST00000458294 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PBRM1-218ENST00000458294 SH3GLB1Q9Y371 365 aa22.28■■□□□ 1.16
PBRM1-218ENST00000458294 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa22.27■■□□□ 1.16
PBRM1-218ENST00000458294 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa22.27■■□□□ 1.16
PBRM1-218ENST00000458294 CST2P09228 141 aa22.27■■□□□ 1.16
PBRM1-218ENST00000458294 ARHGDIAP52565 204 aa22.27■■□□□ 1.16
PBRM1-218ENST00000458294 TAF11Q15544 211 aa22.27■■□□□ 1.16
PBRM1-218ENST00000458294 AGBL2Q5U5Z8 902 aa22.27■■□□□ 1.16
PBRM1-218ENST00000458294 ZER1Q7Z7L7 766 aa22.27■■□□□ 1.16
PBRM1-218ENST00000458294 SPICQ8N5J4 248 aa22.27■■□□□ 1.16
PBRM1-218ENST00000458294 MSL2Q9HCI7 577 aa22.27■■□□□ 1.16
PBRM1-218ENST00000458294 RIMS3Q9UJD0 308 aa22.27■■□□□ 1.16
PBRM1-218ENST00000458294 BAG5Q9UL15 447 aa22.27■■□□□ 1.16
PBRM1-218ENST00000458294 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa22.27■■□□□ 1.16
PBRM1-218ENST00000458294 NGFP01138 241 aa22.26■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 IGHMP01871 453 aa22.26■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 GZMMP51124 257 aa22.26■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 PCBD1P61457 104 aa22.26■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 TMEM155Q4W5P6 130 aa22.26■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 MTX3Q5HYI7 312 aa22.26■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 ARL9Q6T311 187 aa22.26■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 KLHL36Q8N4N3 616 aa22.26■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 C4orf45Q96LM5 186 aa22.26■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 RBP7Q96R05 134 aa22.26■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 NPHS2Q9NP85 383 aa22.26■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 MMP26Q9NRE1 261 aa22.26■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 TMEM106BQ9NUM4 274 aa22.26■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 PLEK2Q9NYT0 353 aa22.26■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 HIF3AQ9Y2N7 669 aa22.26■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 MED31Q9Y3C7 131 aa22.26■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 AUP1Q9Y679 476 aa22.26■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 SBK2P0C263 348 aa22.25■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 THRBP10828 461 aa22.25■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 LAP3P28838 519 aa22.25■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF154Q13106 437 aa22.25■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 CDK5R2Q13319 367 aa22.25■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 LAPTM4AQ15012 233 aa22.25■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 SPRNQ5BIV9 151 aa22.25■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 ALG10Q5BKT4 473 aa22.25■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF69Q9UC07 566 aa22.25■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa22.24■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF12P17014 697 aa22.24■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa22.24■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF283Q8N7M2 679 aa22.24■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 DCAF16Q9NXF7 216 aa22.24■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 EGFL7Q9UHF1 273 aa22.24■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 A8MXK9 166 aa22.23■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 TRAPPC2LH3BP13 241 aa22.23■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 TNFRSF1AP19438 455 aa22.23■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 TNFRSF1BP20333 461 aa22.23■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 TUBG1P23258 451 aa22.23■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 TNFSF4P23510 183 aa22.23■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 SLC6A9P48067 706 aa22.23■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 RPL27P61353 136 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 PSG7Q13046 419 aa22.23■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF774Q6NX45 483 aa22.23■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 SYT9Q86SS6 491 aa22.23■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 NPEPL1Q8NDH3 523 aa22.23■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 DYDC1Q8WWB3 177 aa22.23■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 SAMD8Q96LT4 415 aa22.23■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 MRI1Q9BV20 369 aa22.23■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 TUBG2Q9NRH3 451 aa22.23■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 INSIG2Q9Y5U4 225 aa22.23■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 HTR3EA5X5Y0 456 aa22.22■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 GSTM3P21266 225 aa22.22■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 FAM205BPQ63HN1 556 aa22.22■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 WACQ9BTA9 647 aa22.22■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 C12orf71A8MTZ7 269 aa22.21■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 ABHD16AO95870 558 aa22.21■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 COX5BP10606 129 aa22.21■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 MSR1P21757 451 aa22.21■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 BTG1P62324 171 aa22.21■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 BAMBIQ13145 260 aa22.21■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 NANOGP8Q6NSW7 305 aa22.21■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 DUX5Q96PT3 197 aa22.21■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 SH3GL1Q99961 368 aa22.21■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa22.21■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 TBCCD1Q9NVR7 557 aa22.21■■□□□ 1.15
PBRM1-218ENST00000458294 F5H0A9 414 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PBRM1-218ENST00000458294 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PBRM1-218ENST00000458294 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PBRM1-218ENST00000458294 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PBRM1-218ENST00000458294 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PBRM1-218ENST00000458294 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PBRM1-218ENST00000458294 CALHM3Q86XJ0 350 aa22.2■■□□□ 1.14
PBRM1-218ENST00000458294 CLDN22Q8N7P3 220 aa22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.3 ms