RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 OR52N5Q8NH56 324 aa15.18■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 HMGB4Q8WW32 186 aa15.18■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 ASB5Q8WWX0 329 aa15.18■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 PATE1Q8WXA2 126 aa15.18■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 GPR174Q9BXC1 333 aa15.18■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 PIGMQ9H3S5 423 aa15.18■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 KCNG2Q9UJ96 466 aa15.18■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 TNFSF18Q9UNG2 199 aa15.18■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 TRANK1O15050 2925 aa15.18■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 A8MVM7 634 aa15.17■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 ABCD4O14678 606 aa15.17■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 OIP5O43482 229 aa15.17■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 IGKV3-11P04433 115 aa15.17■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 BTG2P78543 158 aa15.17■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 GLO1Q04760 184 aa15.17■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 FAM189A2Q15884 450 aa15.17■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 PCK2Q16822 640 aa15.17■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 CCDC157Q569K6 752 aa15.17■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 LY6G6FQ5SQ64 297 aa15.17■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 DCAF12L2Q5VW00 463 aa15.17■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 KIAA0895LQ68EN5 471 aa15.17■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 NDUFAF7Q7L592 441 aa15.17■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa15.17■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 STEAP2Q8NFT2 490 aa15.17■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 RAB22AQ9UL26 194 aa15.17■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa15.16■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 RAB19A4D1S5 217 aa15.16■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 OR6C76A6NM76 312 aa15.16■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 TSPAN4O14817 238 aa15.16■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 AMY2AP04746 511 aa15.16■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF735P0CB33 412 aa15.16■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 MAOAP21397 527 aa15.16■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 CD34P28906 385 aa15.16■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 PNLIPRP2P54317 469 aa15.16■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 TAS2R31P59538 309 aa15.16■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 ZP4Q12836 540 aa15.16■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 BTN1A1Q13410 526 aa15.16■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 NNATQ16517 81 aa15.16■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 C2orf68Q2NKX9 166 aa15.16■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 DEFB110Q30KQ9 67 aa15.16■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 C11orf87Q6NUJ2 197 aa15.16■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 CBLN3Q6UW01 205 aa15.16■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa15.16■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 SLC25A42Q86VD7 318 aa15.16■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF584Q8IVC4 421 aa15.16■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 MISPQ8IVT2 679 aa15.16■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 DTWD2Q8NBA8 298 aa15.16■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 ZBTB44Q8NCP5 570 aa15.16■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 OR4D10Q8NGI6 311 aa15.16■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 OR51A4Q8NGJ6 313 aa15.16■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 DUSP19Q8WTR2 217 aa15.16■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 ADIPOR1Q96A54 375 aa15.16■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 SLC38A3Q99624 504 aa15.16■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 RAB33BQ9H082 229 aa15.16■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 LANCL2Q9NS86 450 aa15.16■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 PISDQ9UG56 409 aa15.16■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa15.16■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa15.15■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 OR5H14A6NHG9 310 aa15.15■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 H0YC42 278 aa15.15■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 SIX6O95475 246 aa15.15■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 IL12BP29460 328 aa15.15■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 DNASE1L1P49184 302 aa15.15■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 GPR85P60893 370 aa15.15■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 PPP1CAP62136 330 aa15.15■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 GUCA2AQ02747 115 aa15.15■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF117Q03924 483 aa15.15■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 PMPCAQ10713 525 aa15.15■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 PLA2G7Q13093 441 aa15.15■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 FZD2Q14332 565 aa15.15■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 ACKR1Q16570 336 aa15.15■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 LYG2Q86SG7 212 aa15.15■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 SHISA5Q8N114 240 aa15.15■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 AQP3Q92482 292 aa15.15■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 UQCC2Q9BRT2 126 aa15.15■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 MPDZO75970 2070 aa15.15■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 A0A087WV48 116 aa15.15■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 TLCD2A6NGC4 264 aa15.15■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa15.15■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 TSPAN2O60636 221 aa15.15■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 KDM4BO94953 1096 aa15.15■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 BPNT1O95861 308 aa15.15■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 HLA-DQA2P01906 255 aa15.15■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 PROS1P07225 676 aa15.15■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 RAB3AP20336 220 aa15.15■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 HSD11B1P28845 292 aa15.15■□□□□ 0.02
HCLS1-202ENST00000428394 FNTBP49356 437 aa15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.5 ms