RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411710.1

LIMS1-AS1-201, LIMS1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMS1-AS1, Length 477 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CLEC7AQ9BXN2 247 aa3.05□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GBA3Q9H227 469 aa3.05□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GOLPH3Q9H4A6 298 aa3.05□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF385DQ9H6B1 395 aa3.05□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NANSQ9NR45 359 aa3.05□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MS4A12Q9NXJ0 267 aa3.05□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 WWOXQ9NZC7 414 aa3.05□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa3.05□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 VPS13AQ96RL7 3174 aa3.05□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 A0A087X002 238 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLC22A20A6NK97 555 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 A8MUA0 341 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 B4DXG7 233 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DCTN6O00399 190 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLC17A2O00624 439 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GPAA1O43292 621 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MAGEC1O60732 1142 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ETHE1O95571 254 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CLDN1O95832 211 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PSMB6P28072 239 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FOXN2P32314 431 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 P2RY2P41231 377 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CRATP43155 626 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 EFNA3P52797 238 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CYCSP99999 105 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 STX3Q13277 289 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF146Q15072 292 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MOGAT2Q3SYC2 334 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FFAR4Q5NUL3 377 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 OR52E8Q6IFG1 317 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 UFSP1Q6NVU6 142 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SPESP1Q6UW49 350 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLC35D2Q76EJ3 337 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZFAND4Q86XD8 727 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CMTM1Q8IZ96 169 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SYS1Q8N2H4 156 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C17orf78Q8N4C9 275 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RFLNBQ8N5W9 214 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DNAAF3Q8N9W5 541 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CYB561A3Q8NBI2 242 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 OR7G1Q8NGA0 311 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 OR52B6Q8NGF0 335 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 OR4D6Q8NGJ1 314 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LYPD6BQ8NI32 183 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LMO3Q8TAP4 145 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CAPSLQ8WWF8 208 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TNFRSF14Q92956 283 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ECHDC3Q96DC8 303 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CCDC126Q96EE4 140 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SH3GL1Q99961 368 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CCDC28BQ9BUN5 200 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TMEM59Q9BXS4 323 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ANGPTL4Q9BY76 406 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CAB39LQ9H9S4 337 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SDHAF3Q9NRP4 125 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IFNKQ9P0W0 207 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SPRR3Q9UBC9 169 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KIF25Q9UIL4 384 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 Q9Y3F1 56 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 AUP1Q9Y679 476 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PCNX1Q96RV3 2341 aa3.04□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PLIN4Q96Q06 1357 aa3.03□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FOCADQ5VW36 1801 aa3.03□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GON4LQ3T8J9 2241 aa3.03□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IGSF10Q6WRI0 2623 aa3.03□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 A0A1W2PQ72 361 aa3.03□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 E7ESA3 106 aa3.03□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CCL21O00585 134 aa3.03□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RFXANKO14593 260 aa3.03□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GOSR2O14653 212 aa3.03□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 AIM2O14862 343 aa3.03□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ENTPD5O75356 428 aa3.03□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZMPSTE24O75844 475 aa3.03□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SMC2O95347 1197 aa3.03□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FARS2O95363 451 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LCA5LO95447 670 aa3.03□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CST4P01036 141 aa3.03□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KLK1P06870 262 aa3.03□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GNB3P16520 340 aa3.03□□□□□ -1.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms