RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 WNT11O96014 354 aa3.55□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 PNPP00491 289 aa3.55□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 HPP00738 406 aa3.55□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 RAB40ALP0C0E4 278 aa3.55□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 CD97P48960 835 aa3.55□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 INPP1P49441 399 aa3.55□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 RIDAP52758 137 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
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LRRTM4-201ENST00000409088 CLRN1P58418 232 aa3.55□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 WDR38Q5JTN6 314 aa3.55□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 CDCP2Q5VXM1 449 aa3.55□□□□□ -1.84
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LRRTM4-201ENST00000409088 DCXRQ7Z4W1 244 aa3.55□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC26A10Q8NG04 563 aa3.55□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 OR10H5Q8NGA6 315 aa3.55□□□□□ -1.84
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LRRTM4-201ENST00000409088 RPS4Y2Q8TD47 263 aa3.55□□□□□ -1.84
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LRRTM4-201ENST00000409088 PHYHIPQ92561 330 aa3.55□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM106AQ96A25 262 aa3.55□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 PPP1R14BQ96C90 147 aa3.55□□□□□ -1.84
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LRRTM4-201ENST00000409088 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
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LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF726A6NNF4 738 aa3.55□□□□□ -1.84
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LRRTM4-201ENST00000409088 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
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LRRTM4-201ENST00000409088 SERPINA7P05543 415 aa3.55□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 NPR2P20594 1047 aa3.55□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 KIR3DL2P43630 455 aa3.55□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 RFX2P48378 723 aa3.55□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 P2RY4P51582 365 aa3.55□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 CLDN17P56750 224 aa3.55□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC35A1P78382 337 aa3.55□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa3.55□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 MFAP5Q13361 173 aa3.55□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
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LRRTM4-201ENST00000409088 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 BEST3Q8N1M1 668 aa3.55□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 DNAAF1Q8NEP3 725 aa3.55□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 OR52N5Q8NH56 324 aa3.55□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 SETD6Q8TBK2 473 aa3.55□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa3.55□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 GPR148Q8TDV2 347 aa3.55□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 RNF128Q8TEB7 428 aa3.55□□□□□ -1.84
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LRRTM4-201ENST00000409088 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 C4orf45Q96LM5 186 aa3.55□□□□□ -1.84
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LRRTM4-201ENST00000409088 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 SLITRK2Q9H156 845 aa3.55□□□□□ -1.84
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LRRTM4-201ENST00000409088 PITPNBP48739 271 aa3.54□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 CYB561P49447 251 aa3.54□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 CHAF1BQ13112 559 aa3.54□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 THEM4Q5T1C6 240 aa3.54□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 SPINK14Q6IE38 97 aa3.54□□□□□ -1.84
LRRTM4-201ENST00000409088 STAC2Q6ZMT1 411 aa3.54□□□□□ -1.84
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