RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM212A6NML5 194 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 FAM166BA8MTA8 275 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 GABRPO00591 440 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 RAMP1O60894 148 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 UPK3AO75631 287 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 SC5DO75845 299 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ARL6IP5O75915 188 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 QDPRP09417 244 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 CFL1P23528 166 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 EDNRAP25101 427 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 STARP49675 285 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF84P51523 738 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 RIDAP52758 137 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 HCCSP53701 268 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 RPS25P62851 125 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 FABP5Q01469 135 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.028e-7■■■■□ 23.2
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POLR1A-202ENST00000409024 ZNF404Q494X3 552 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 TP53I3Q53FA7 332 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 YIF1BQ5BJH7 314 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 LIPNQ5VXI9 398 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 YIPF7Q8N8F6 280 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 OR6N1Q8NGY5 312 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 OR52N5Q8NH56 324 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ABHD4Q8TB40 342 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 TBC1D15Q8TC07 691 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 RNF128Q8TEB7 428 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 AP3S1Q92572 193 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 PGLYRP3Q96LB9 341 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 UCN2Q96RP3 112 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 LINC00470Q9BZP3 86 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 C1orf198Q9H425 327 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 RERGLQ9H628 205 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 LDAHQ9H6V9 325 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 BCO1Q9HAY6 547 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 GLRX2Q9NS18 164 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF175Q9Y473 711 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ITPR3Q14573 2671 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ITPR2Q14571 2701 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ANKRD61A6NGH8 418 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ACOD1A6NK06 481 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 MKRN2OSH3BPM6 223 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 K7ENP7 123 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 AQP7O14520 342 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 TFECO14948 347 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 DHHO43323 396 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 RAF1P04049 648 aa8.68□□□□□ -1.02
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POLR1A-202ENST00000409024 FCGR2AP12318 317 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF24P17028 368 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 MTNR1BP49286 362 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 GDI2P50395 445 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 LRFN4Q6PJG9 635 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ARL9Q6T311 187 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 Q6ZS92 163 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 AAED1Q7RTV5 226 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 KRT77Q7Z794 578 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 UBQLNLQ8IYU4 475 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 MCFD2Q8NI22 146 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 CPT1CQ8TCG5 803 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 RNF133Q8WVZ7 376 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 C11orf40Q8WZ69 217 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 NSMAFQ92636 917 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 GHSRQ92847 366 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 SLC25A46Q96AG3 418 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 TM9SF2Q99805 663 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ABHD6Q9BV23 337 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 PRDM14Q9GZV8 571 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 COMMD4Q9H0A8 199 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 SLC6A15Q9H2J7 730 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 NELFAQ9H3P2 528 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 EXO5Q9H790 373 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 POLE4Q9NR33 117 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 GALNT8Q9NY28 637 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 IKZF2Q9UKS7 526 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF281Q9Y2X9 895 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 PEX16Q9Y5Y5 336 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 CENPEQ02224 2701 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 OR14I1A6ND48 311 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF879B4DU55 563 aa8.67□□□□□ -1.02
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