RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402697.5

PRAME-203, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PRAME, Length 2,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-203ENST00000402697 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 DUSP23Q9BVJ7 150 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 CHST11Q9NPF2 352 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 NPIPA1Q9UND3 350 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 LRP12Q9Y561 859 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 MAB21L2Q9Y586 359 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 ADAMTS20P59510 1910 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 A0A1W2PNV4 684 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 VSTM2BA6NLU5 285 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 HMSDA8MTL9 139 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 ADAM10O14672 748 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 LPLP06858 475 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 MYF5P13349 255 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 HTR2CP28335 458 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 ZNF81P51508 661 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 MMP16P51512 607 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 RAB14P61106 215 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 POMZP3Q6PJE2 187 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 TSSK4Q6SA08 328 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 NDUFAF7Q7L592 441 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 OR51A4Q8NGJ6 313 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 OR10AC1Q8NH08 325 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 MRGPRX4Q96LA9 322 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 IER2Q9BTL4 223 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 ALKBH4Q9NXW9 302 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 FLVCR2Q9UPI3 526 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 UNC13CQ8NB66 2214 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 A0A1B0GTH9 108 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 OR2M5A3KFT3 312 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 TSC22D2O75157 780 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 ITGA5P08648 1049 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 GIMD1P0DJR0 217 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 RAD52P43351 418 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 GRK1Q15835 563 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 Q6ZTK2 550 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 COX15Q7KZN9 410 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 ANKRD37Q7Z713 158 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 SLC25A45Q8N413 288 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 OR4C16Q8NGL9 310 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 OR1J4Q8NGS1 313 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 CEP76Q8TAP6 659 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 EDAQ92838 391 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 SLC25A28Q96A46 364 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 KCNK17Q96T54 332 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 ZNF69Q9UC07 566 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 TRAV18A0A075B6X5 111 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 OR6C65A6NJZ3 312 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 MS4A18H0YCH9 400 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 M0R233 179 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 WNT11O96014 354 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 PNPP00491 289 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 PLGP00747 810 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 HEXBP07686 556 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 ATXN8OSP0DMR3 200 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 DNASE1L1P49184 302 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 SELENOPP49908 381 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 GMFBP60983 142 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 TSPAN5P62079 268 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 RPS15P62841 145 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 ZMYND11Q15326 602 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 MS4A18Q3C1V0 323 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 MAMSTRQ6ZN01 415 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 SLC35D2Q76EJ3 337 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 FTMTQ8N4E7 242 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 CLEC1AQ8NC01 280 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 APCDD1LQ8NCL9 501 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 CMKLR1Q99788 373 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 SERINC1Q9NRX5 453 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 KLHL13Q9P2N7 655 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 SUSD2Q9UGT4 822 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 EXPH5Q8NEV8 1989 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 SPEGQ15772 3267 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 A0A1W2PQ72 361 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 PLSCR5A0PG75 271 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 LEUTXA8MZ59 168 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 G3V3Q6 166 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 LDLRAD4O15165 306 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 ALOX12BO75342 701 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 HOXA6P31267 233 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 GSK3AP49840 483 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 HSF1Q00613 529 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-203ENST00000402697 STPG1Q5TH74 334 aa11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.5 ms