RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401498.6

PKDCC-202, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 1,550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-202ENST00000401498 NRGNQ92686 78 aa26.12■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 NEUROG1Q92886 237 aa26.12■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 OTULINQ96BN8 352 aa26.12■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 PLEKHA8Q96JA3 519 aa26.12■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 RADILQ96JH8 1075 aa26.12■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 MOKQ9UQ07 419 aa26.12■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 ORC6Q9Y5N6 252 aa26.12■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 SPG11Q96JI7 2443 aa26.12■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 POLQO75417 2590 aa26.12■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 RTTNQ86VV8 2226 aa26.12■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 C12orf71A8MTZ7 269 aa26.12■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 CALCRP30988 508 aa26.12■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 RAD23AP54725 363 aa26.12■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 PSG4Q00888 419 aa26.12■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 TRIP10Q15642 601 aa26.12■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa26.12■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 PLBD1Q6P4A8 553 aa26.12■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 SLC22A25Q6T423 547 aa26.12■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 SYT9Q86SS6 491 aa26.12■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 FBXL3Q9UKT7 428 aa26.12■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa26.12■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 PLCE1Q9P212 2302 aa26.11■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa26.11■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 HLA-DQA2P01906 255 aa26.11■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 PAICSP22234 425 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 PCBD1P61457 104 aa26.11■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 TEKQ02763 1124 aa26.11■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 SLC34A1Q06495 639 aa26.11■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 LPCAT4Q643R3 524 aa26.11■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 LYPD4Q6UWN0 246 aa26.11■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 CPOQ8IVL8 374 aa26.11■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 LURAP1Q96LR2 239 aa26.11■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 WACQ9BTA9 647 aa26.11■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 OR2H1Q9GZK4 316 aa26.11■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 LIME1Q9H400 295 aa26.11■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 PRKYO43930 277 aa26.1■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 CRYAAP02489 173 aa26.1■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 EFNB1P98172 346 aa26.1■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 LINC01590Q5TEZ4 76 aa26.1■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 AKR7LQ8NHP1 331 aa26.1■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP26.1■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 WNT5BQ9H1J7 359 aa26.1■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 ASH2LQ9UBL3 628 aa26.1■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa26.09■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 M0R129 80 aa26.09■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 AQP6Q13520 282 aa26.09■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 LRRC36Q1X8D7 754 aa26.09■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 IL17RDQ8NFM7 739 aa26.09■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 MBOAT4Q96T53 435 aa26.09■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 GRIP2Q9C0E4 1043 aa26.09■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 OR51V1Q9H2C8 321 aa26.09■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 LHFPL6Q9Y693 200 aa26.09■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 PDZD2O15018 2839 aa26.09■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 TVP23AA6NH52 213 aa26.08■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 PEX2P28328 305 aa26.08■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 PLP2Q04941 152 aa26.08■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF511Q8NB15 262 aa26.08■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 BBS1Q8NFJ9 593 aa26.08■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 PRRG3Q9BZD7 231 aa26.08■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 TOR3AQ9H497 397 aa26.08■■□□□ 1.77
PKDCC-202ENST00000401498 E9PQ18 207 aa26.07■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 SNAP29O95721 258 aa26.07■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF35P13682 527 aa26.07■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 FMO3P31513 532 aa26.07■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 GGT2P36268 569 aa26.07■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF774Q6NX45 483 aa26.07■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 DEPDC4Q8N2C3 294 aa26.07■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 TCEANCQ8N8B7 351 aa26.07■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 OR6K6Q8NGW6 343 aa26.07■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 KCNS3Q9BQ31 491 aa26.07■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 UBTD1Q9HAC8 227 aa26.07■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 CSMD1Q96PZ7 3565 aa26.07■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa26.07■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 HS3ST1O14792 307 aa26.07■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 APEX1P27695 318 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 CDH11P55287 796 aa26.07■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 B3GLCTQ6Y288 498 aa26.07■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 SLC30A7Q8NEW0 376 aa26.07■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 OR10H5Q8NGA6 315 aa26.07■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 WDR76Q9H967 626 aa26.07■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 POU2F3Q9UKI9 436 aa26.07■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 POLR1DQ9Y2S0 133 aa26.07■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 NOTCH2Q04721 2471 aa26.06■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 GLCEO94923 617 aa26.06■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 CCL2P13500 99 aa26.06■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 SCRN3Q0VDG4 424 aa26.06■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 CORO6Q6QEF8 472 aa26.06■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 GALNT4Q8N4A0 578 aa26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.9 ms