RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000387416.2

MT-TS1-201, Transcript of mitochondrially encoded tRNA serine 1 (UCN), humanhuman

BASIC

Gene MT-TS1, Length 69 nt, Biotype Mt tRNA, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-TS1-201ENST00000387416 NOS3P29474 1203 aa7.32□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 CDAP32320 146 aa7.32□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 LIPAP38571 399 aa7.32□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 RASSF2P50749 326 aa7.32□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 ARHGDIAP52565 204 aa7.32□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 PPP2R2BQ00005 443 aa7.32□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 PSG4Q00888 419 aa7.32□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 PCGF3Q3KNV8 242 aa7.32□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF718Q3SXZ3 478 aa7.32□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC36A3Q495N2 470 aa7.32□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 MESTQ5EB52 335 aa7.32□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 OR2T5Q6IEZ7 315 aa7.32□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 RINLQ6ZS11 566 aa7.32□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 JAZF1Q86VZ6 243 aa7.32□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF786Q8N393 782 aa7.32□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 OR52L1Q8NGH7 329 aa7.32□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 OR2T29Q8NH02 315 aa7.32□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 SYNPRQ8TBG9 265 aa7.32□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 FANK1Q8TC84 345 aa7.32□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 SNX33Q8WV41 574 aa7.32□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 POM121L2Q96KW2 1035 aa7.32□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 SORCS2Q96PQ0 1159 aa7.32□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 PIMREGQ9BSJ6 248 aa7.32□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 IFT27Q9BW83 186 aa7.32□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF416Q9BWM5 594 aa7.32□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 OR52D1Q9H346 318 aa7.32□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 REEP1Q9H902 201 aa7.32□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 BAIAP2Q9UQB8 552 aa7.32□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa7.32□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa7.31□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa7.31□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa7.31□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 TCRBV5S2A0A599 114 aa7.31□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 C5orf49A4QMS7 147 aa7.31□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 VWC2LB2RUY7 222 aa7.31□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 SGCEO43556 437 aa7.31□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 CD5LO43866 347 aa7.31□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC16A7O60669 478 aa7.31□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 CCNB2O95067 398 aa7.31□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 IGHV3-13P01766 116 aa7.31□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 DAOP14920 347 aa7.31□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 CTLA4P16410 223 aa7.31□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 ATP6V1B2P21281 511 aa7.31□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 GCH1P30793 250 aa7.31□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 MS4A2Q01362 244 aa7.31□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 TEKQ02763 1124 aa7.31□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 GLO1Q04760 184 aa7.31□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 COX10Q12887 443 aa7.31□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 AQP6Q13520 282 aa7.31□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 NKPD1Q17RQ9 610 aa7.31□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 PGBD2Q6P3X8 592 aa7.31□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM154Q6P9G4 183 aa7.31□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 THSD4Q6ZMP0 1018 aa7.31□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa7.31□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF525Q8N782 197 aa7.31□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 CLDN22Q8N7P3 220 aa7.31□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 UBASH3BQ8TF42 649 aa7.31□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 RASD2Q96D21 266 aa7.31□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 GPA33Q99795 319 aa7.31□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 SMR3AQ99954 134 aa7.31□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 BTBD10Q9BSF8 475 aa7.31□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 THTPAQ9BU02 230 aa7.31□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 DGCR6LQ9BY27 220 aa7.31□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 RACGAP1Q9H0H5 632 aa7.31□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 WNT5BQ9H1J7 359 aa7.31□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 SYT4Q9H2B2 425 aa7.31□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 CYSLTR2Q9NS75 346 aa7.31□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 TBCCD1Q9NVR7 557 aa7.31□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa7.31□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 IL20Q9NYY1 176 aa7.31□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 DUSP13Q9UII6 198 aa7.31□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 KCNG2Q9UJ96 466 aa7.31□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 CDH10Q9Y6N8 788 aa7.31□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 VPS13CQ709C8 3753 aa7.31□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 CR1P17927 2039 aa7.3□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 LOC100509620A0A075B734 347 aa7.3□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 A0A1W2PPW3 197 aa7.3□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 ARRDC5A6NEK1 342 aa7.3□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 SOCS2O14508 198 aa7.3□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 ACOT8O14734 319 aa7.3□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 GPRIN2O60269 458 aa7.3□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 PPP1R3DO95685 299 aa7.3□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM157BP0CG42 384 aa7.3□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 CCNOP22674 350 aa7.3□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 NR4A2P43354 598 aa7.3□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 CENPAP49450 140 aa7.3□□□□□ -1.24
MT-TS1-201ENST00000387416 RGS6P49758 472 aa7.3□□□□□ -1.24
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