RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 OR9A2Q8NGT5 310 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 KLK6Q92876 244 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 SLC35A4Q96G79 324 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 COX14Q96I36 57 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF681Q96N22 645 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 OR1F2PQ96R84 312 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 SDF2Q99470 211 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 PRRT1Q99946 306 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 PTDSS2Q9BVG9 487 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 KLHL31Q9H511 634 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 RNF122Q9H9V4 155 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 PRDM7Q9NQW5 492 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 CA14Q9ULX7 337 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1W2PPK0 400 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 C1orf196B1AJZ1 125 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 F5H0A9 414 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 SCGNO76038 276 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 GLCEO94923 617 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 PPP1R3DO95685 299 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 CYB5AP00167 134 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 IGF2P01344 180 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 APEHP13798 732 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 GABRG2P18507 467 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 MST1P26927 711 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 CERS1P27544 350 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 LUMP51884 338 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 CDK3Q00526 305 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 TNFRSF17Q02223 184 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 TFF2Q03403 129 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 SMCO1Q147U7 214 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 MTFR2Q6P444 385 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF793Q6ZN11 406 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF550Q7Z398 422 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 LDLRAD3Q86YD5 345 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF547Q8IVP9 402 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ZDHHC22Q8N966 263 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 SLC30A7Q8NEW0 376 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 TSTD1Q8NFU3 115 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 OR4K14Q8NGD5 310 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 OR52E2Q8NGJ4 325 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 OR51S1Q8NGJ8 323 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 OR52B4Q8NGK2 314 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 OR2L8Q8NGY9 312 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 IL17FQ96PD4 163 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 PHB2Q99623 299 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF426Q9BUY5 554 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 SMCO4Q9NRQ5 59 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 RXFP3Q9NSD7 469 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 POT1Q9NUX5 634 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM100Q9NV29 134 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 SLC2A8Q9NY64 477 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 MYOTQ9UBF9 498 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 SERGEFQ9UGK8 458 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 CHRNA9Q9UGM1 479 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ERVK-19Q9WJR5 959 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ATG4BQ9Y4P1 393 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 WIF1Q9Y5W5 379 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 KCNE3Q9Y6H6 103 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 SPACA6W5XKT8 324 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 A0A0B4J2E0 115 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1B0GX12 115 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 OR6C74A6NCV1 312 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 OR6C68A6NDL8 312 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 RHPN2P1A8MT19 583 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 PIN1P1O15428 100 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 SGCEO43556 437 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 SSX5O60225 188 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 FCMRO60667 390 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 RAB3DO95716 219 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 PCCBP05166 539 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF806P0C7X5 589 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ABOP16442 354 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 TBPP20226 339 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 MPZP25189 248 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 CMPK1P30085 196 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 PMELP40967 661 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 FNTBP49356 437 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 CENPAP49450 140 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 CCR5P51681 352 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 SLC25A1P53007 311 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 TAS2R31P59538 309 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 SSTP61278 116 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 PEA15Q15121 130 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ALG11Q2TAA5 492 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms