RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367367.8

PTPRC-203, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 2,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-203ENST00000367367 OSBPL10Q9BXB5 764 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 C1orf21Q9H246 121 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 PIGMQ9H3S5 423 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 TMEM27Q9HBJ8 222 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 TMEM165Q9HC07 324 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 C20orf141Q9NUB4 165 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 B3GAT1Q9P2W7 334 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 BAG5Q9UL15 447 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 A4GNTQ9UNA3 340 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 PRELID1Q9Y255 219 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 TRAPPC4Q9Y296 219 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 SESN1Q9Y6P5 492 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP2.76□□□□□ -1.971e-11■■■■□ 24.8
PTPRC-203ENST00000367367 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 ABCA2Q9BZC7 2435 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 SH3D21A4FU49 640 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 TRAPPC13A5PLN9 417 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 AQP7P3A6NL99 342 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 ENO4A6NNW6 628 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 hCG_2039718K7EN88 272 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 FFAR1O14842 300 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
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PTPRC-203ENST00000367367 LYZL6O75951 148 aa2.75□□□□□ -1.97
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PTPRC-203ENST00000367367 CH25HO95992 272 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 HPRP00739 348 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 GASTP01350 101 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 IFNA14P01570 189 aa2.75□□□□□ -1.97
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PTPRC-203ENST00000367367 IFNW1P05000 195 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 HLA-DOBP13765 273 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 HSD17B1P14061 328 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 NQO1P15559 274 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 ZNF3P17036 446 aa2.75□□□□□ -1.97
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PTPRC-203ENST00000367367 FUT1P19526 365 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 ATP6V1B2P21281 511 aa2.75□□□□□ -1.97
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PTPRC-203ENST00000367367 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 CD79BP40259 229 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 SELENOPP49908 381 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 ERFP50548 548 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 MNAT1P51948 309 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 UGT2B15P54855 530 aa2.75□□□□□ -1.97
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PTPRC-203ENST00000367367 VLDLRP98155 873 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 SORDQ00796 357 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 TLE4Q04727 773 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 LTBQ06643 244 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 SLC17A1Q14916 467 aa2.75□□□□□ -1.97
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PTPRC-203ENST00000367367 IFI44LQ53G44 452 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 C9orf135Q5VTT2 229 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 TMEM225Q6GV28 225 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 GLYATQ6IB77 296 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 CASP12Q6UXS9 341 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 CBLL1Q75N03 491 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 TMEM200AQ86VY9 491 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 WDFY1Q8IWB7 410 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 ZNF100Q8IYN0 542 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 GABRG1Q8N1C3 465 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 UBE2J2Q8N2K1 259 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 C10orf53Q8N6V4 93 aa2.75□□□□□ -1.97
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PTPRC-203ENST00000367367 NUDT10Q8NFP7 164 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 OR9K2Q8NGE7 335 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 OR56B2PQ8NGI1 322 aa2.75□□□□□ -1.97
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PTPRC-203ENST00000367367 PIGXQ8TBF5 258 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
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PTPRC-203ENST00000367367 MED18Q9BUE0 208 aa2.75□□□□□ -1.97
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PTPRC-203ENST00000367367 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa2.75□□□□□ -1.97
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PTPRC-203ENST00000367367 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 GLRX2Q9NS18 164 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-203ENST00000367367 TAS2R1Q9NYW7 299 aa2.75□□□□□ -1.97
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PTPRC-203ENST00000367367 CD300AQ9UGN4 299 aa2.75□□□□□ -1.97
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