RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 DNM1P46Q6ZS02 220 aa23.23■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 GLB1L2Q8IW92 636 aa23.23■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 GIPC3Q8TF64 312 aa23.23■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 C18orf12Q96KH6 178 aa23.23■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 COX4I2Q96KJ9 171 aa23.23■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 POM121L2Q96KW2 1035 aa23.23■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 SYT3Q9BQG1 590 aa23.23■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 C1orf198Q9H425 327 aa23.23■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 TBC1D23Q9NUY8 699 aa23.23■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 B9D1Q9UPM9 204 aa23.23■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 FAM171A2A8MVW0 826 aa23.22■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 GNGT2O14610 69 aa23.22■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 SNAP29O95721 258 aa23.22■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 CCNOP22674 350 aa23.22■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 STOMP27105 288 aa23.22■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 APLNRP35414 380 aa23.22■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 WNT5AP41221 380 aa23.22■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP23.22■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 RAB35Q15286 201 aa23.22■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa23.22■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 NPEPL1Q8NDH3 523 aa23.22■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 SNX18Q96RF0 628 aa23.22■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 TSSK6Q9BXA6 273 aa23.22■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 CMAHPQ9Y471 501 aa23.22■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 SPEF1Q9Y4P9 236 aa23.22■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa23.22■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa23.22■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 C12orf71A8MTZ7 269 aa23.21■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 TIPRLO75663 272 aa23.21■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 RENP00797 406 aa23.21■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 PRKACGP22612 351 aa23.21■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 CENPAP49450 140 aa23.21■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 NUDT6P53370 316 aa23.21■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF101Q8IZC7 436 aa23.21■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 CYB561A3Q8NBI2 242 aa23.21■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 DDOQ99489 341 aa23.21■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 NTN4Q9HB63 628 aa23.21■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 REV1Q9UBZ9 1251 aa23.21■■□□□ 1.31
TPGS1-201ENST00000359315 ARRDC5A6NEK1 342 aa23.2■■□□□ 1.3
TPGS1-201ENST00000359315 IDH3BO43837 385 aa23.2■■□□□ 1.3
TPGS1-201ENST00000359315 PTHP01270 115 aa23.2■■□□□ 1.3
TPGS1-201ENST00000359315 GSTM3P21266 225 aa23.2■■□□□ 1.3
TPGS1-201ENST00000359315 CCNIQ14094 377 aa23.2■■□□□ 1.3
TPGS1-201ENST00000359315 GK3PQ14409 553 aa23.2■■□□□ 1.3
TPGS1-201ENST00000359315 ASRGL1Q7L266 308 aa23.2■■□□□ 1.3
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF525Q8N782 197 aa23.2■■□□□ 1.3
TPGS1-201ENST00000359315 ZNRF4Q8WWF5 429 aa23.2■■□□□ 1.3
TPGS1-201ENST00000359315 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
TPGS1-201ENST00000359315 RACGAP1Q9H0H5 632 aa23.2■■□□□ 1.3
TPGS1-201ENST00000359315 ASH2LQ9UBL3 628 aa23.2■■□□□ 1.3
TPGS1-201ENST00000359315 DNAJB9Q9UBS3 223 aa23.2■■□□□ 1.3
TPGS1-201ENST00000359315 C5orf49A4QMS7 147 aa23.19■■□□□ 1.3
TPGS1-201ENST00000359315 E2F6O75461 281 aa23.19■■□□□ 1.3
TPGS1-201ENST00000359315 INHBBP09529 407 aa23.19■■□□□ 1.3
TPGS1-201ENST00000359315 BMP4P12644 408 aa23.19■■□□□ 1.3
TPGS1-201ENST00000359315 CRABP1P29762 137 aa23.19■■□□□ 1.3
TPGS1-201ENST00000359315 PCBD1P61457 104 aa23.19■■□□□ 1.3
TPGS1-201ENST00000359315 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
TPGS1-201ENST00000359315 SLC36A3Q495N2 470 aa23.19■■□□□ 1.3
TPGS1-201ENST00000359315 C1orf146Q5VVC0 180 aa23.19■■□□□ 1.3
TPGS1-201ENST00000359315 CD300LDQ6UXZ3 194 aa23.19■■□□□ 1.3
TPGS1-201ENST00000359315 SYT9Q86SS6 491 aa23.19■■□□□ 1.3
TPGS1-201ENST00000359315 LNX2Q8N448 690 aa23.19■■□□□ 1.3
TPGS1-201ENST00000359315 IQCF1Q8N6M8 205 aa23.19■■□□□ 1.3
TPGS1-201ENST00000359315 SLC37A3Q8NCC5 494 aa23.19■■□□□ 1.3
TPGS1-201ENST00000359315 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa23.19■■□□□ 1.3
TPGS1-201ENST00000359315 OR1J2Q8NGS2 313 aa23.19■■□□□ 1.3
TPGS1-201ENST00000359315 BDH2Q9BUT1 245 aa23.19■■□□□ 1.3
TPGS1-201ENST00000359315 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa23.18■■□□□ 1.3
TPGS1-201ENST00000359315 TFP02787 698 aa23.18■■□□□ 1.3
TPGS1-201ENST00000359315 FOSL1P15407 271 aa23.18■■□□□ 1.3
TPGS1-201ENST00000359315 PPOXP50336 477 aa23.18■■□□□ 1.3
TPGS1-201ENST00000359315 GDI2P50395 445 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
TPGS1-201ENST00000359315 EFNA4P52798 201 aa23.18■■□□□ 1.3
TPGS1-201ENST00000359315 UCP2P55851 309 aa23.18■■□□□ 1.3
TPGS1-201ENST00000359315 KCNMB1Q16558 191 aa23.18■■□□□ 1.3
TPGS1-201ENST00000359315 DNM1P34Q6PK57 102 aa23.18■■□□□ 1.3
TPGS1-201ENST00000359315 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa23.18■■□□□ 1.3
TPGS1-201ENST00000359315 ZBTB46Q86UZ6 589 aa23.18■■□□□ 1.3
TPGS1-201ENST00000359315 ICA1LQ8NDH6 482 aa23.18■■□□□ 1.3
TPGS1-201ENST00000359315 SLC26A10Q8NG04 563 aa23.18■■□□□ 1.3
TPGS1-201ENST00000359315 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
TPGS1-201ENST00000359315 MED13LQ71F56 2210 aa23.18■■□□□ 1.3
TPGS1-201ENST00000359315 ACANP16112 2415 aa23.17■■□□□ 1.3
TPGS1-201ENST00000359315 RNF223E7ERA6 249 aa23.17■■□□□ 1.3
TPGS1-201ENST00000359315 RER1O15258 196 aa23.17■■□□□ 1.3
TPGS1-201ENST00000359315 DOK2O60496 412 aa23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms