RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF442Q9H7R0 627 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 TCF7L1Q9HCS4 588 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 SNTG1Q9NSN8 517 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 ABCD2Q9UBJ2 740 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 KLK4Q9Y5K2 254 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 ITPR3Q14573 2671 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 EML5Q05BV3 1969 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa3.93□□□□□ -1.78
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PTPRC-201ENST00000348564 OR2B2Q9GZK3 357 aa3.93□□□□□ -1.78
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PTPRC-201ENST00000348564 C17orf51A8MQB3 221 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 B9A039 149 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 TRAPPC2LH3BP13 241 aa3.93□□□□□ -1.78
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PTPRC-201ENST00000348564 GPX2P18283 190 aa3.93□□□□□ -1.78
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PTPRC-201ENST00000348564 EVA1AQ9H8M9 152 aa3.93□□□□□ -1.78
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PTPRC-201ENST00000348564 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 CDK2AP1O14519 115 aa3.93□□□□□ -1.78
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PTPRC-201ENST00000348564 TBX19O60806 448 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 OR7A10O76100 309 aa3.93□□□□□ -1.78
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PTPRC-201ENST00000348564 C1QCP02747 245 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 IGKV3-11P04433 115 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
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PTPRC-201ENST00000348564 TMEM255BQ8WV15 326 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 TMIGD2Q96BF3 282 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 DUX5Q96PT3 197 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 SLX1AQ9BQ83 275 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 HINT2Q9BX68 163 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 SLC38A1Q9H2H9 487 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 SYNGR3O43761 229 aa3.92□□□□□ -1.78
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