RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 PRPS1P60891 318 aa15.16■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 EDAQ92838 391 aa15.16■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 ADGRL4Q9HBW9 690 aa15.16■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 ICKQ9UPZ9 632 aa15.16■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 TAAR5O14804 337 aa15.16■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 CXCL14O95715 111 aa15.16■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 OMGP23515 440 aa15.16■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 RPL12P30050 165 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa15.16■□□□□ 0.02
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PACS1-201ENST00000320580 SLC25A28Q96A46 364 aa15.16■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
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PACS1-201ENST00000320580 C2orf68Q2NKX9 166 aa15.15■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 Q96M85 177 aa15.15■□□□□ 0.02
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PACS1-201ENST00000320580 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP15.15■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 EHFQ9NZC4 300 aa15.15■□□□□ 0.02
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PACS1-201ENST00000320580 HSD11B1P28845 292 aa15.15■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 CTGFP29279 349 aa15.15■□□□□ 0.02
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PACS1-201ENST00000320580 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa15.15■□□□□ 0.02
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PACS1-201ENST00000320580 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 FAM185AQ8N0U4 392 aa15.15■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 PIK3IP1Q96FE7 263 aa15.15■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 TSSK2Q96PF2 358 aa15.15■□□□□ 0.02
PACS1-201ENST00000320580 SRMSQ9H3Y6 488 aa15.15■□□□□ 0.02
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PACS1-201ENST00000320580 SULF2Q8IWU5 870 aa15.14■□□□□ 0.01
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PACS1-201ENST00000320580 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
PACS1-201ENST00000320580 CSNK1A1LQ8N752 337 aa15.14■□□□□ 0.01
PACS1-201ENST00000320580 CDRT4Q8N9R6 151 aa15.14■□□□□ 0.01
PACS1-201ENST00000320580 SLC39A7Q92504 469 aa15.14■□□□□ 0.01
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PACS1-201ENST00000320580 ZNF345Q14585 488 aa15.13■□□□□ 0.01
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PACS1-201ENST00000320580 SLC35A4Q96G79 324 aa15.13■□□□□ 0.01
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PACS1-201ENST00000320580 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
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PACS1-201ENST00000320580 S100GP29377 79 aa15.13■□□□□ 0.01
PACS1-201ENST00000320580 THBS2P35442 1172 aa15.13■□□□□ 0.01
PACS1-201ENST00000320580 HERV-K104P61576 105 aa15.13■□□□□ 0.01
PACS1-201ENST00000320580 REC114Q7Z4M0 266 aa15.13■□□□□ 0.01
PACS1-201ENST00000320580 TMEM229BQ8NBD8 167 aa15.13■□□□□ 0.01
PACS1-201ENST00000320580 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa15.13■□□□□ 0.01
PACS1-201ENST00000320580 OR52A4PA6NMU1 304 aa15.13■□□□□ 0.01
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