RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 PHLDA2Q53GA4 152 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM217Q8N7C4 229 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 PBX4Q9BYU1 374 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 BARHL1Q9BZE3 327 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 TAAR5O14804 337 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 CTXN2P0C2S0 81 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 HTRA3P83110 453 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 KCND3Q9UK17 655 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM127O75204 238 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 TSPAN12O95859 305 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 LAP3P28838 519 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 TAF9BQ9HBM6 251 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 KPTNQ9Y664 436 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 HLA-HP01893 362 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 HCCSP53701 268 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 FABP5Q01469 135 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 GABRG1Q8N1C3 465 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 OR13C8Q8NGS7 320 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 GNG13Q9P2W3 67 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 OR6C76A6NM76 312 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 SPINT2O43291 252 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 HPNP05981 417 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 DEFA6Q01524 100 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 CDK5R1Q15078 307 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 FJX1Q86VR8 437 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 KCNJ15Q99712 375 aa19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 STMND1H3BQB6 276 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 SLAMF6Q96DU3 332 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 ARV1Q9H2C2 271 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 BANF2Q9H503 90 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 LTB4R2Q9NPC1 389 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 BTBD17A6NE02 478 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 IFITM5A6NNB3 132 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 HLA-DOBP13765 273 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 RBP2P50120 134 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 PRTGQ2VWP7 1150 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 PARM1Q6UWI2 310 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 SYT13Q7L8C5 426 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 MMP17Q9ULZ9 603 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 ALS2Q96Q42 1657 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 C4orf47A7E2U8 309 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 NFYBP25208 207 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 H0YIG0 161 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 GABRB1P18505 474 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 GAREM1Q9H706 876 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 AKIP1Q9NQ31 210 aa19.3■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 POM121BA6NF01 834 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 UPK1AO00322 258 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 ETHE1O95571 254 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 KCNRGQ8N5I3 272 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 ST8SIA1Q92185 356 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF732B4DXR9 585 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 F6UZH7 168 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 PSMB3P49720 205 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 RHOUQ7L0Q8 258 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 EMC6Q9BV81 110 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 APEHP13798 732 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 GPR85P60893 370 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 Q6ZNB5 142 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 APH1AQ96BI3 265 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1B0GUL6 1792 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD34BA5PLL1 514 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 CCSO14618 274 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 THEM4Q5T1C6 240 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 H3F3CQ6NXT2 135 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 MT-ND4LP03901 98 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 CLDN20P56880 219 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM71Q6P5X7 295 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00696Q6ZRV3 163 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 CA13Q8N1Q1 262 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 UCN3Q969E3 161 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 CDCP1Q9H5V8 836 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 CSF3P09919 207 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 ALOX5APP20292 161 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 DUSP1P28562 367 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 TBC1D28Q2M2D7 210 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 VHLLQ6RSH7 139 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 SUMF1Q8NBK3 374 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 MVB12AQ96EY5 273 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 JTBO76095 146 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 SCGB1D1O95968 90 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 H0Y8X5 98 aa19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.1 ms