RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283875.5

GTF2E1-201, Transcript of general transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF2E1, Length 3,012 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF432O94892 652 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 SLC16A8O95907 504 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 TOMM40O96008 361 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 IGLV3-25P01717 112 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 FCARP24071 287 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 DUSP8Q13202 625 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 OR7A5Q15622 319 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 OR2T2Q6IF00 324 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 PODNL1Q6PEZ8 512 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 PRSS57Q6UWY2 283 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 BHLHA9Q7RTU4 235 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 ADCK2Q7Z695 626 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 FOXRED2Q8IWF2 684 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 C17orf47Q8NEP4 570 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 MIB2Q96AX9 1013 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 AQP10Q96PS8 301 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 COMMD4Q9H0A8 199 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 POFUT1Q9H488 388 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 SERINC1Q9NRX5 453 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 UPB1Q9UBR1 384 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 IL20RAQ9UHF4 553 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 TBX21Q9UL17 535 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 AMDHD2Q9Y303 409 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 ETV7Q9Y603 341 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 IFITM5A6NNB3 132 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 M0R036 132 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 GPR39O43194 453 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF208O43345 1280 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 ALOX12BO75342 701 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 NDUFS3O75489 264 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 SLCO2B1O94956 709 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 NBEAP1P0C6P0 100 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 PNLIPP16233 465 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 IGFALSP35858 605 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 TNFSF10P50591 281 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 TAS2R20P59543 309 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 ACTBP60709 375 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 ACTA2P62736 377 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 ACTG1P63261 375 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 ACTG2P63267 376 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 ACTC1P68032 377 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 ACTA1P68133 377 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 CDC42EP1Q00587 391 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 TAF13Q15543 124 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 TRIM40Q6P9F5 258 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 FBXW12Q6X9E4 464 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 KMT5CQ86Y97 462 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 SYT12Q8IV01 421 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 FRMD1Q8N878 549 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 FRZBQ92765 325 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 TMEM169Q96HH4 297 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 RNF126Q9BV68 326 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 VAX2Q9UIW0 290 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 GPR52Q9Y2T5 361 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 HELZP42694 1942 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 HIDE1A8MVS5 230 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 UMAD1C9J7I0 102 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 DCTN6O00399 190 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 NARSO43776 548 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 AKAIN1P0CW23 69 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 CFPP27918 469 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 PCSK1P29120 753 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 NTHL1P78549 312 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 PAX5Q02548 391 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 TAF10Q12962 218 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 DHRS2Q13268 280 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 NFATC2Q13469 925 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 DUSP5Q16690 384 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 ATP6V1FQ16864 119 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 TMEM69Q5SWH9 247 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 NPAS4Q8IUM7 802 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 CLEC1AQ8NC01 280 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 OR4D11Q8NGI4 311 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 APOLD1Q96LR9 279 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 GNRHR2Q96P88 292 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 KLHL5Q96PQ7 755 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 NMES1Q9C002 83 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 IGFLR1Q9H665 355 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 CDH20Q9HBT6 801 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 Q9N2J8 555 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 A4GALTQ9NPC4 353 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 NRIP3Q9NQ35 241 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 SLC23A2Q9UGH3 650 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa6.67□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 TMEM235A6NFC5 223 aa6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61 ms