RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264010.8

CTCF-201, Transcript of CCCTC-binding factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCF, Length 3,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCF-201ENST00000264010 AKR7LQ8NHP1 331 aa14.75□□□□□ -0.05
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CTCF-201ENST00000264010 A0A0B4J203 849 aa14.75□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 IDSB3KWA1 339 aa14.75□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 ATF1P18846 271 aa14.75□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 RGS19P49795 217 aa14.75□□□□□ -0.05
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CTCF-201ENST00000264010 ACKR1Q16570 336 aa14.75□□□□□ -0.05
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CTCF-201ENST00000264010 MARC2Q969Z3 335 aa14.75□□□□□ -0.05
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CTCF-201ENST00000264010 LANCL2Q9NS86 450 aa14.75□□□□□ -0.05
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CTCF-201ENST00000264010 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa14.74□□□□□ -0.05
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CTCF-201ENST00000264010 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa14.74□□□□□ -0.05
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CTCF-201ENST00000264010 TUSC1Q2TAM9 212 aa14.74□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa14.74□□□□□ -0.05
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CTCF-201ENST00000264010 CTSFQ9UBX1 484 aa14.74□□□□□ -0.05
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CTCF-201ENST00000264010 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa14.73□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 AIPO00170 330 aa14.73□□□□□ -0.05
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CTCF-201ENST00000264010 OR7E24Q6IFN5 339 aa14.73□□□□□ -0.05
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CTCF-201ENST00000264010 DUSP18Q8NEJ0 188 aa14.73□□□□□ -0.05
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CTCF-201ENST00000264010 RCE1Q9Y256 329 aa14.73□□□□□ -0.05
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CTCF-201ENST00000264010 TSTD3H0UI37 97 aa14.73□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 FADS1O60427 444 aa14.73□□□□□ -0.05
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CTCF-201ENST00000264010 ZNF721Q8TF20 911 aa14.73□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 C20orf24Q9BUV8 137 aa14.73□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 OR11A1Q9GZK7 315 aa14.73□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa14.73□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 PRSS37A4D1T9 235 aa14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 MEGF11A6BM72 1044 aa14.72□□□□□ -0.05
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