RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256151.7

CCDC59-201, Transcript of coiled-coil domain containing 59, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC59, Length 1,983 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59-201ENST00000256151 PRODH2Q9UF12 536 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 DHDHQ9UQ10 334 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 DTX4Q9Y2E6 619 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 PQLC2LA1A4F0 135 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 F8VVB4 439 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 F8VWA3 439 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 SULT2B1O00204 365 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 SLC31A1O15431 190 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 TNFRSF4P43489 277 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 PPICP45877 212 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 FNTBP49356 437 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 SKP1P63208 163 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 EGR4Q05215 589 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 SKP2Q13309 424 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 HFEQ30201 348 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 FAM74A1Q5RGS3 127 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 C1orf100Q5SVJ3 147 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 ASPHD2Q6ICH7 369 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 SLC18B1Q6NT16 456 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 RAB11FIP2Q7L804 512 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 TMED4Q7Z7H5 227 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 THAP6Q8TBB0 222 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 DGAT2Q96PD7 388 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 CCDC3Q9BQI4 270 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 ULBP3Q9BZM4 244 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 UBQLN4Q9NRR5 601 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 TMEM100Q9NV29 134 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 OR10H1Q9Y4A9 318 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa14.58□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa14.58□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 POM121BA6NF01 834 aa14.58□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 ZNF98A6NK75 572 aa14.58□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 K7EQS6 105 aa14.58□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 GLULP15104 373 aa14.58□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 CASRP41180 1078 aa14.58□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 PGDP52209 483 aa14.58□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 DCDP81605 110 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 PMPCAQ10713 525 aa14.58□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 ELOCQ15369 112 aa14.58□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 TAF13Q15543 124 aa14.58□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa14.58□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 RAB12Q6IQ22 244 aa14.58□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 CCL4L1Q8NHW4 92 aa14.58□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 PDCD10Q9BUL8 212 aa14.58□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 ADAM19Q9H013 955 aa14.58□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 OR10A5Q9H207 317 aa14.58□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 ATPIF1Q9UII2 106 aa14.58□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 GMEB2Q9UKD1 530 aa14.58□□□□□ -0.07
CCDC59-201ENST00000256151 F13BP05160 661 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC59-201ENST00000256151 CD79AP11912 226 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC59-201ENST00000256151 PVRP15151 417 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC59-201ENST00000256151 CTHP32929 405 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC59-201ENST00000256151 BIKQ13323 160 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC59-201ENST00000256151 SERTAD2Q14140 314 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC59-201ENST00000256151 MEP1BQ16820 701 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC59-201ENST00000256151 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CCDC59-201ENST00000256151 CATSPERDQ86XM0 798 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC59-201ENST00000256151 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CCDC59-201ENST00000256151 C16orf52Q8NHV5 167 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC59-201ENST00000256151 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC59-201ENST00000256151 ASB5Q8WWX0 329 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC59-201ENST00000256151 ZNF75AQ96N20 296 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC59-201ENST00000256151 CDC6Q99741 560 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC59-201ENST00000256151 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CCDC59-201ENST00000256151 KCNG2Q9UJ96 466 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC59-201ENST00000256151 PCDHB10Q9UN67 800 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC59-201ENST00000256151 B9D1Q9UPM9 204 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC59-201ENST00000256151 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC59-201ENST00000256151 TGFBR3LH3BV60 316 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC59-201ENST00000256151 M0QYG6 137 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC59-201ENST00000256151 HRKO00198 91 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC59-201ENST00000256151 SLC25A12O75746 678 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC59-201ENST00000256151 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CCDC59-201ENST00000256151 SLC6A8P48029 635 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC59-201ENST00000256151 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CCDC59-201ENST00000256151 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CCDC59-201ENST00000256151 C3orf33Q6P1S2 294 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC59-201ENST00000256151 ZNF627Q7L945 461 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC59-201ENST00000256151 ZNF615Q8N8J6 731 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC59-201ENST00000256151 OR9A4Q8NGU2 314 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC59-201ENST00000256151 AQP3Q92482 292 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC59-201ENST00000256151 PHB2Q99623 299 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC59-201ENST00000256151 SLC6A7Q99884 636 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC59-201ENST00000256151 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC59-201ENST00000256151 SLC39A1Q9NY26 324 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC59-201ENST00000256151 ATG2BQ96BY7 2078 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC59-201ENST00000256151 CLDN4O14493 209 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC59-201ENST00000256151 IL33O95760 270 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC59-201ENST00000256151 TBPP20226 339 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC59-201ENST00000256151 BDKRB2P30411 391 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC59-201ENST00000256151 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CCDC59-201ENST00000256151 CBX5P45973 191 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.6 ms