RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218348.7

USP11-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 11, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP11, Length 3,338 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11-201ENST00000218348 RENP00797 406 aa8.97□□□□□ -0.97
USP11-201ENST00000218348 PNLIPP16233 465 aa8.97□□□□□ -0.97
USP11-201ENST00000218348 HSD17B12Q53GQ0 312 aa8.97□□□□□ -0.97
USP11-201ENST00000218348 C1orf140Q5VVS0 124 aa8.97□□□□□ -0.97
USP11-201ENST00000218348 PLET1Q6UQ28 207 aa8.97□□□□□ -0.97
USP11-201ENST00000218348 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
USP11-201ENST00000218348 FAM122BQ7Z309 247 aa8.97□□□□□ -0.97
USP11-201ENST00000218348 WDFY1Q8IWB7 410 aa8.97□□□□□ -0.97
USP11-201ENST00000218348 ZNF676Q8N7Q3 588 aa8.97□□□□□ -0.97
USP11-201ENST00000218348 FAM71CQ8NEG0 241 aa8.97□□□□□ -0.97
USP11-201ENST00000218348 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
USP11-201ENST00000218348 SMIM19Q96E16 107 aa8.97□□□□□ -0.97
USP11-201ENST00000218348 MED18Q9BUE0 208 aa8.97□□□□□ -0.97
USP11-201ENST00000218348 SLC22A4Q9H015 551 aa8.97□□□□□ -0.97
USP11-201ENST00000218348 A0A0A6YYJ9 748 aa8.96□□□□□ -0.97
USP11-201ENST00000218348 ARGFXA6NJG6 315 aa8.96□□□□□ -0.97
USP11-201ENST00000218348 AHSA1O95433 338 aa8.96□□□□□ -0.97
USP11-201ENST00000218348 CTLA4P16410 223 aa8.96□□□□□ -0.97
USP11-201ENST00000218348 RPS18P62269 152 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
USP11-201ENST00000218348 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
USP11-201ENST00000218348 CBFBQ13951 182 aa8.96□□□□□ -0.97
USP11-201ENST00000218348 HFEQ30201 348 aa8.96□□□□□ -0.97
USP11-201ENST00000218348 SSX9Q7RTT3 188 aa8.96□□□□□ -0.97
USP11-201ENST00000218348 LGALS14Q8TCE9 139 aa8.96□□□□□ -0.97
USP11-201ENST00000218348 WDFY2Q96P53 400 aa8.96□□□□□ -0.97
USP11-201ENST00000218348 JAM3Q9BX67 310 aa8.96□□□□□ -0.97
USP11-201ENST00000218348 SLC19A3Q9BZV2 496 aa8.96□□□□□ -0.97
USP11-201ENST00000218348 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa8.96□□□□□ -0.97
USP11-201ENST00000218348 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa8.96□□□□□ -0.97
USP11-201ENST00000218348 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
USP11-201ENST00000218348 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 PIN1P1O15428 100 aa8.96□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 FZD7O75084 574 aa8.96□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 CER1O95813 267 aa8.96□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 KLK2P20151 261 aa8.96□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 VAMP1P23763 118 aa8.96□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 STPG1Q5TH74 334 aa8.96□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 HBMQ6B0K9 141 aa8.96□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 ATRAIDQ6UW56 229 aa8.96□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 CHMP1BQ7LBR1 199 aa8.96□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 FAM220AQ7Z4H9 259 aa8.96□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 SLITRK4Q8IW52 837 aa8.96□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 PFDN5Q99471 154 aa8.96□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 CENPMQ9NSP4 180 aa8.96□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 ARPC3O15145 178 aa8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 MAP2K3P46734 347 aa8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 MTNR1BP49286 362 aa8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 P2RX1P51575 399 aa8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 DGCR2P98153 550 aa8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 SPEM2Q0P670 501 aa8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 POU4F2Q12837 409 aa8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 FOXF1Q12946 379 aa8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 GDPD1Q8N9F7 314 aa8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 Q8NFD4 153 aa8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 OR6S1Q8NH40 331 aa8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 AKR7LQ8NHP1 331 aa8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 SLC7A6Q92536 515 aa8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 DDOQ99489 341 aa8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 ADAM19Q9H013 955 aa8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 UFSP2Q9NUQ7 469 aa8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 CACNA1GO43497 2377 aa8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 A0A0B4J293 547 aa8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 METTL21EPA6NDL7 271 aa8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 LYRM1O43325 122 aa8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 IFNGR1P15260 489 aa8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 ACP1P24666 158 aa8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 CCKBRP32239 447 aa8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 THBS2P35442 1172 aa8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 ACTA2P62736 377 aa8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 ACTG2P63267 376 aa8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 ADAM8P78325 824 aa8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 ACSM1Q08AH1 577 aa8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 FCRLAQ7L513 359 aa8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 ZFP82Q8N141 532 aa8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 POMGNT2Q8NAT1 580 aa8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 BEST4Q8NFU0 473 aa8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 OR2T4Q8NH00 348 aa8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 SEMA4CQ9C0C4 833 aa8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 ABCG5Q9H222 651 aa8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 AUNIPQ9H7T9 357 aa8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 ELOVL3Q9HB03 270 aa8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 FRRS1LQ9P0K9 344 aa8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 SRPK3Q9UPE1 567 aa8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 ARID1AO14497 2285 aa8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 A0A0G2JK05 382 aa8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 FADS1O60427 444 aa8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 BGLAPP02818 100 aa8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 SYPP08247 313 aa8.95□□□□□ -0.98
USP11-201ENST00000218348 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms