RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	STMN2	Q93045	179 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	TADA1	Q96BN2	335 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC126	Q96EE4	140 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	THTPA	Q9BU02	230 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	HINT2	Q9BX68	163 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	EML4	Q9HC35	981 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	DEC1	Q9P2X7	70 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	PCSK5	Q92824	1860 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		4.22	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A0D9SEW6	157 aa		4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A1B0GUS0	222 aa		4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	PSMG1	O95456	288 aa		4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	FGF1	P05230	155 aa		4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC166	P0CW27	439 aa		4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	THRA	P10827	490 aa		4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	COX4I1	P13073	169 aa		4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	HOXB2	P14652	356 aa		4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	CCNO	P22674	350 aa		4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	GCK	P35557	465 aa		4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	SERPINB5	P36952	375 aa		4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	OR3A2	P47893	321 aa		4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	IST1	P53990	364 aa		4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	RGS1	Q08116	209 aa		4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616		Q0VFX4	171 aa		4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	H3F3C	Q6NXT2	135 aa		4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	C8orf44	Q96CB5	159 aa		4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	NUS1	Q96E22	293 aa		4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	OMA1	Q96E52	524 aa		4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	LRRC42	Q9Y546	428 aa		4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	BPTF	Q12830	3046 aa		4.21	□□□□□ -1.73
EFHC1-223	ENST00000636616	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	EI24	O14681	340 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	PFDN6	O15212	129 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	INSIG1	O15503	277 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	CHST1	O43916	411 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	TBL1X	O60907	577 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	KCNJ13	O60928	360 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	RHOC	P08134	193 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF24	P17028	368 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	DCK	P27707	260 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	HMOX2	P30519	316 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	OPRD1	P41143	372 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	CLDN18	P56856	261 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	ACVR1	Q04771	509 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	DLG1	Q12959	904 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	SELENBP1	Q13228	472 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	IHH	Q14623	411 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	NCF4	Q15080	339 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	ISX	Q2M1V0	245 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	RFTN2	Q52LD8	501 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616		Q6ZSR3	168 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	LSMEM2	Q8N112	164 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM104	Q8NE00	496 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	OR4F6	Q8NGB9	312 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EFHC1-223	ENST00000636616	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		4.21	□□□□□ -1.74

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