RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	IFNGR1	P15260	489 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	P2RX3	P56373	397 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	GLO1	Q04760	184 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	TEX261	Q6UWH6	196 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	RNF128	Q8TEB7	428 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	GPR137	Q96N19	417 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	CA10	Q9NS85	328 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152		U3KQ87	197 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1B0GVI7	797 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	GGT3P	A6NGU5	568 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	PUDP	Q08623	228 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	APCDD1L	Q8NCL9	501 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	C8orf44	Q96CB5	159 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	EMC6	Q9BV81	110 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	RLN1	P04808	185 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	HEXB	P07686	556 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	LCN1	P31025	176 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	FTMT	Q8N4E7	242 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	EID2	Q8N6I1	236 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	OR6C1	Q96RD1	312 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	CDK2AP1	O14519	115 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	OR2T1	O43869	369 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	TGM6	O95932	706 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	SLC26A5	P58743	744 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	RAB11B	Q15907	218 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	TEX30	Q5JUR7	227 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	OR1J4	Q8NGS1	313 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	ASB5	Q8WWX0	329 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	HGD	Q93099	445 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	C5orf34	Q96MH7	638 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	DIABLO	Q9NR28	239 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	CENPM	Q9NSP4	180 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1B0GUH1	482 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	OR6C76	A6NM76	312 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	NPIPA5	E9PKD4	350 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	MS4A18	H0YCH9	400 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	ADAM10	O14672	748 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	OR3A3	P47888	321 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	SPOCK1	Q08629	439 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM225	Q6GV28	225 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	PLPP5	Q8NEB5	264 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	SLC25A44	Q96H78	314 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	GINS4	Q9BRT9	223 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	NPIPA1	Q9UND3	350 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152		G3V3Q6	166 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	LMX1B	O60663	402 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	PRAF2	O60831	178 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	GTF2F2	P13984	249 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF823	P16415	610 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	TSPAN5	P62079	268 aa		11.74	□□□□□ -0.53

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