RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607519.1

GMDS-AS1-216, humanhuman

TSL 4

Gene GMDS-AS1, Length 579 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SLC2A5P22732 501 aa9.15□□□□□ -0.94
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PCYT1AP49585 367 aa9.15□□□□□ -0.94
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SLC25A1P53007 311 aa9.15□□□□□ -0.94
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TGFBR3Q03167 851 aa9.15□□□□□ -0.94
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PPA1Q15181 289 aa9.15□□□□□ -0.94
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KLHL12Q53G59 568 aa9.15□□□□□ -0.94
GMDS-AS1-216ENST00000607519 C6orf52Q5T4I8 152 aa9.15□□□□□ -0.94
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZNF787Q6DD87 383 aa9.15□□□□□ -0.94
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CORO6Q6QEF8 472 aa9.15□□□□□ -0.94
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa9.15□□□□□ -0.94
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MDP1Q86V88 176 aa9.15□□□□□ -0.94
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PACRGLQ8N7B6 248 aa9.15□□□□□ -0.94
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PROKR2Q8NFJ6 384 aa9.15□□□□□ -0.94
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FAM81AQ8TBF8 368 aa9.15□□□□□ -0.94
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HSD17B8Q92506 261 aa9.15□□□□□ -0.94
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LRRC46Q96FV0 321 aa9.15□□□□□ -0.94
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HRASLS5Q96KN8 279 aa9.15□□□□□ -0.94
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SLC38A2Q96QD8 506 aa9.15□□□□□ -0.94
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SNX18Q96RF0 628 aa9.15□□□□□ -0.94
GMDS-AS1-216ENST00000607519 WDR76Q9H967 626 aa9.15□□□□□ -0.94
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SIAEQ9HAT2 523 aa9.15□□□□□ -0.94
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RASSF1Q9NS23 344 aa9.15□□□□□ -0.94
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa9.15□□□□□ -0.94
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GMPPBQ9Y5P6 360 aa9.15□□□□□ -0.94
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FKBP7Q9Y680 259 aa9.15□□□□□ -0.94
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CELSR2Q9HCU4 2923 aa9.15□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SLC16A6O15403 523 aa9.14□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ENTPD6O75354 484 aa9.14□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PLAUP00749 431 aa9.14□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HLA-DQA2P01906 255 aa9.14□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 OR8G3PP0DMU2 310 aa9.14□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 EPXP11678 715 aa9.14□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LOXP28300 417 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CRABP1P29762 137 aa9.14□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SORDQ00796 357 aa9.14□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TEKQ02763 1124 aa9.14□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 APOFQ13790 326 aa9.14□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RAB39AQ14964 217 aa9.14□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TIMM23BQ5SRD1 257 aa9.14□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 AADACL4Q5VUY2 407 aa9.14□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 OR7E24Q6IFN5 339 aa9.14□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZNF627Q7L945 461 aa9.14□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SLC16A14Q7RTX9 510 aa9.14□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LINC00346Q8IVM7 164 aa9.14□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GLB1L2Q8IW92 636 aa9.14□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa9.14□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DHRSXQ8N5I4 330 aa9.14□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SLC26A10Q8NG04 563 aa9.14□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 OR6K6Q8NGW6 343 aa9.14□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 AKR7LQ8NHP1 331 aa9.14□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TMEM163Q8TC26 289 aa9.14□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZNF75AQ96N20 296 aa9.14□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HS3ST6Q96QI5 342 aa9.14□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PITX2Q99697 317 aa9.14□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NDRG3Q9UGV2 375 aa9.14□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LHFPL6Q9Y693 200 aa9.14□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NOTCH2Q04721 2471 aa9.13□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DEFB108AA8MXU0 73 aa9.13□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 M0R1B8 84 aa9.13□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SELENOFO60613 162 aa9.13□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 APOL3O95236 402 aa9.13□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CCL2P13500 99 aa9.13□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 COX6B1P14854 86 aa9.13□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZNF32P17041 273 aa9.13□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GABRB1P18505 474 aa9.13□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NPR2P20594 1047 aa9.13□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MSR1P21757 451 aa9.13□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GSTT1P30711 240 aa9.13□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RAB1AP62820 205 aa9.13□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PSG4Q00888 419 aa9.13□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HSF2Q03933 536 aa9.13□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SPOCK1Q08629 439 aa9.13□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KCNMB1Q16558 191 aa9.13□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FAM27BQ5VT28 67 aa9.13□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZNF774Q6NX45 483 aa9.13□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TMEM154Q6P9G4 183 aa9.13□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SHFQ7M4L6 423 aa9.13□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ENTHD1Q8IYW4 607 aa9.13□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZNF555Q8NEP9 628 aa9.13□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 OR2T4Q8NH00 348 aa9.13□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FAM222BQ8WU58 562 aa9.13□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SLC7A6Q92536 515 aa9.13□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NEUROG1Q92886 237 aa9.13□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MUCL1Q96DR8 90 aa9.13□□□□□ -0.95
GMDS-AS1-216ENST00000607519 BOD1Q96IK1 185 aa9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms