RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 H3BSA7 217 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 UPK3AO75631 287 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 SULT1C4O75897 302 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 SPARCP09486 303 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 PLXDC2Q6UX71 529 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM57AQ8TBR7 257 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 C4orf36Q96KX1 117 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 BCL7BQ9BQE9 202 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 CDADC1Q9BWV3 514 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 ATMQ13315 3056 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 TACSTD2P09758 323 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 CPEP16870 476 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 NPR2P20594 1047 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 LIPAP38571 399 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 RGS6P49758 472 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 TMBIM6P55061 237 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 TPBGQ13641 420 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF585AQ6P3V2 769 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 FUNDC2Q9BWH2 189 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 CLEC4AQ9UMR7 237 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 KRT33AO76009 404 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 MPZL1O95297 269 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 CD36P16671 472 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 MSR1P21757 451 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 CD79BP40259 229 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 GPR50Q13585 617 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 MEP1BQ16820 701 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 NRN1LQ496H8 165 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF684Q5T5D7 378 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 GPR107Q5VW38 600 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 THEM6Q8WUY1 208 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 CRLF2Q9HC73 371 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC160A6NGH7 325 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 J3QLW9 94 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 ERVH48-1M5A8F1 160 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 TPOP07202 933 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF19P17023 458 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 OR12D2P58182 307 aa27.38■■□□□ 1.97
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CAPNS1-206ENST00000588815 TSTQ16762 297 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 TSPO2Q5TGU0 170 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 FOXB2Q5VYV0 432 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF100Q8IYN0 542 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 RFLNBQ8N5W9 214 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB2BQ8WUD1 216 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 UFD1Q92890 307 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 GPR35Q9HC97 309 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 EMC9Q9Y3B6 208 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 NOL3O60936 208 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 KRT8P05787 483 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 ABOP16442 354 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 TGFBR2P37173 567 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 ROM1Q03395 351 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 C19orf48Q6RUI8 117 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 RHOUQ7L0Q8 258 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM214BQ7L5A3 538 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM220AQ7Z4H9 259 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 P2RY8Q86VZ1 359 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 KLBQ86Z14 1044 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
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CAPNS1-206ENST00000588815 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
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CAPNS1-206ENST00000588815 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC58Q4VC31 144 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 DEGS2Q6QHC5 323 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 ZFP3Q96NJ6 502 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 DOK1Q99704 481 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 ABHD6Q9BV23 337 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC7A10Q9NS82 523 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 UPB1Q9UBR1 384 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 ENPP5Q9UJA9 477 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 POLR1DQ9Y2S0 133 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF587BE7ETH6 402 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-206ENST00000588815 CRHP06850 196 aa27.36■■□□□ 1.97
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