RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588170.5

GRN-212, Transcript of granulin precursor, human

TSL 2

Gene GRN, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRN-212	ENST00000588170	LNX2	Q8N448	690 aa		13.09	□□□□□ -0.31
GRN-212	ENST00000588170	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		13.09	□□□□□ -0.31
GRN-212	ENST00000588170	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		13.09	□□□□□ -0.31
GRN-212	ENST00000588170	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
GRN-212	ENST00000588170	OR52L1	Q8NGH7	329 aa		13.09	□□□□□ -0.31
GRN-212	ENST00000588170	OR5K1	Q8NHB7	308 aa		13.09	□□□□□ -0.31
GRN-212	ENST00000588170	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
GRN-212	ENST00000588170	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		13.09	□□□□□ -0.31
GRN-212	ENST00000588170	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
GRN-212	ENST00000588170	FBXW5	Q969U6	566 aa		13.09	□□□□□ -0.31
GRN-212	ENST00000588170	NRBF2	Q96F24	287 aa		13.09	□□□□□ -0.31
GRN-212	ENST00000588170	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
GRN-212	ENST00000588170	POLE4	Q9NR33	117 aa		13.09	□□□□□ -0.31
GRN-212	ENST00000588170	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		13.09	□□□□□ -0.31
GRN-212	ENST00000588170	B9D1	Q9UPM9	204 aa		13.09	□□□□□ -0.31
GRN-212	ENST00000588170	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		13.09	□□□□□ -0.31
GRN-212	ENST00000588170	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		13.08	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		13.08	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	RAB36	O95755	333 aa		13.08	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	CRYAA	P02489	173 aa		13.08	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	SERPINA5	P05154	406 aa		13.08	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	CCL2	P13500	99 aa		13.08	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	ANXA8	P13928	327 aa		13.08	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	ZNF32	P17041	273 aa		13.08	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	POU1F1	P28069	291 aa		13.08	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	SLC36A2	Q495M3	483 aa		13.08	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		13.08	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	FAHD1	Q6P587	224 aa		13.08	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		13.08	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		13.08	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		13.08	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	NINJ1	Q92982	152 aa		13.08	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	CCL19	Q99731	98 aa		13.08	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	PKP2	Q99959	881 aa		13.08	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		13.08	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170		G3V2T6	193 aa		13.07	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170		H3BN98	237 aa		13.07	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	ENTPD5	O75356	428 aa		13.07	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	REN	P00797	406 aa		13.07	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	CST2	P09228	141 aa		13.07	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	ZNF35	P13682	527 aa		13.07	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	MSR1	P21757	451 aa		13.07	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	CENPA	P49450	140 aa		13.07	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	ARHGDIA	P52565	204 aa		13.07	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	PSG4	Q00888	419 aa		13.07	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	GINS1	Q14691	196 aa		13.07	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	MEP1B	Q16820	701 aa		13.07	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		13.07	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		13.07	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		13.07	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		13.07	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		13.07	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		13.07	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	OR2T33	Q8NG76	320 aa		13.07	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		13.07	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		13.07	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	MBD6	Q96DN6	1003 aa		13.07	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	SNX18	Q96RF0	628 aa		13.07	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		13.07	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		13.07	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	BDH2	Q9BUT1	245 aa		13.07	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		13.07	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		13.07	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		13.07	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		13.07	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	EDAR	Q9UNE0	448 aa		13.07	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		13.06	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	OSM	P13725	252 aa		13.06	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	CRABP1	P29762	137 aa		13.06	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	PYCR1	P32322	319 aa		13.06	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	FABP6	P51161	128 aa		13.06	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	ART1	P52961	327 aa		13.06	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	CRMP1	Q14194	572 aa		13.06	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	TESK1	Q15569	626 aa		13.06	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	VHLL	Q6RSH7	139 aa		13.06	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		13.06	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		13.06	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		13.06	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		13.06	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	HIVEP1	P15822	2718 aa		13.06	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		13.05	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		13.05	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	TF	P02787	698 aa		13.05	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	GAA	P10253	952 aa		13.05	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	CLU	P10909	449 aa		13.05	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	FCGR1A	P12314	374 aa		13.05	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	ZNF23	P17027	643 aa		13.05	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	TTK	P33981	857 aa		13.05	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	THBS4	P35443	961 aa		13.05	□□□□□ -0.32
GRN-212	ENST00000588170	CDK5	Q00535	292 aa		13.05	□□□□□ -0.32

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